40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1295 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  100 
 
 		 170 aa  343  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  70.59 
 
 		 170 aa  245  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  50.67 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1658  putative outer membrane lipoprotein  43.56 
 
 		 169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  47.71 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  46.3 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5431  outer membrane lipoprotein LolB  51.94 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  44.44 
 
 		 171 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0953  putative outer membrane lipoprotein  42.68 
 
 		 174 aa  97.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3496  hypothetical protein  36.81 
 
 		 198 aa  90.9  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  40.37 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  31.72 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0756  outer membrane lipoprotein LolB  30 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0588  outer membrane lipoprotein LolB  30 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0129159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0572  outer membrane lipoprotein LolB  30 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00109042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  34.51 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0515  outer membrane lipoprotein LolB  27.1 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00665146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1505  outer membrane lipoprotein LolB  30.25 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0117996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0085  outer membrane lipoprotein LolB  30.25 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3117  outer membrane lipoprotein LolB  30.25 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.632142  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2933  outer membrane lipoprotein LolB  30.25 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127236  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0587  outer membrane lipoprotein LolB  29.68 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178798  hitchhiker  0.00290914 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  27.69 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2860  outer membrane lipoprotein LolB  26.74 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0477  outer membrane lipoprotein LolB  28.05 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2718  outer membrane lipoprotein LolB  26.74 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000827751  normal  0.448755 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6130  outer membrane lipoprotein LolB  27.74 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000431335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4131  outer membrane lipoprotein LolB  29.68 
 
 		 211 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2811  outer membrane lipoprotein LolB  28.78 
 
 		 206 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2186  outer membrane lipoprotein LolB  28.78 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2800  outer membrane lipoprotein LolB  28.78 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0768098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  30.07 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  30.15 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0252  outer membrane lipoprotein LolB  28.43 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  34.09 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  26.59 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  30 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  28.07 
 
 		 495 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  25.64 
 
 		 247 aa  41.2  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  29.55 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>