25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0826 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  100 
 
 		 171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  97.08 
 
 		 171 aa  331  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  51.83 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5431  outer membrane lipoprotein LolB  58.27 
 
 		 182 aa  147  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  46.3 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  43.24 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1658  putative outer membrane lipoprotein  42 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  41.36 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0953  putative outer membrane lipoprotein  43.42 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3496  hypothetical protein  40.28 
 
 		 198 aa  97.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  40.38 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  36.43 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000178523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  34.07 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  35.29 
 
 		 495 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  34.41 
 
 		 494 aa  48.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  29.68 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4131  outer membrane lipoprotein LolB  32.14 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0587  outer membrane lipoprotein LolB  32.14 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178798  hitchhiker  0.00290914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  32.71 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0515  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00665146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  34.31 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2718  outer membrane lipoprotein LolB  32.22 
 
 		 201 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000827751  normal  0.448755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2860  outer membrane lipoprotein LolB  32.22 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6130  outer membrane lipoprotein LolB  32.22 
 
 		 206 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000431335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0279  outer membrane lipoprotein LolB  29.9 
 
 		 207 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>