43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3608 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3608  putative lipoprotein  100 
 
 		 174 aa  335  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0826  putative lipoprotein  51.83 
 
 		 171 aa  157  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0897  putative lipoprotein  50.61 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5431  outer membrane lipoprotein LolB  60.94 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1295  putative lipoprotein  47.71 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1658  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  43.03 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  47.37 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0953  putative outer membrane lipoprotein  46.84 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3496  hypothetical protein  38.62 
 
 		 198 aa  85.1  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3231  hypothetical protein  34.38 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  33.69 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  40 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  32.39 
 
 		 204 aa  48.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  27.5 
 
 		 495 aa  47.8  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 		 200 aa  47.8  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0344  outer membrane lipoprotein LolB  34.21 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0391337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0588  outer membrane lipoprotein LolB  28.75 
 
 		 204 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0129159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0572  outer membrane lipoprotein LolB  28.75 
 
 		 207 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00109042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0756  outer membrane lipoprotein LolB  28.75 
 
 		 207 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0085  outer membrane lipoprotein LolB  28.75 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1505  outer membrane lipoprotein LolB  28.75 
 
 		 219 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0117996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3117  outer membrane lipoprotein LolB  28.75 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.632142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1988  outer membrane lipoprotein LolB  27.38 
 
 		 207 aa  44.7  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.253229  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  28.03 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  26.4 
 
 		 210 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2933  outer membrane lipoprotein LolB  28.75 
 
 		 201 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1933  outer membrane lipoprotein LolB  27.21 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000607555  normal  0.239463 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  30.33 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1690  outer membrane lipoprotein LolB  26.53 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000307213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01194  hypothetical protein  26.53 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  26.09 
 
 		 494 aa  41.6  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1373  outer membrane lipoprotein LolB  27.52 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.52349e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2417  outer membrane lipoprotein LolB  26.53 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1357  outer membrane lipoprotein LolB  26.53 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000990201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1314  outer membrane lipoprotein LolB  26.53 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01184  outer membrane lipoprotein LolB precursor  26.53 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2438  outer membrane lipoprotein LolB  26.53 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243213  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1910  outer membrane lipoprotein LolB  26.92 
 
 		 207 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.728098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1974  outer membrane lipoprotein LolB  26.92 
 
 		 207 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356364  normal  0.962813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1916  outer membrane lipoprotein LolB  26.92 
 
 		 207 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1360  outer membrane lipoprotein LolB  26.92 
 
 		 207 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1544  outer membrane lipoprotein LolB  26.92 
 
 		 207 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0381388  normal  0.080998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>