83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0087 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0087  hypothetical protein  100 
 
 		 665 aa  1358    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1361  hypothetical protein  42.11 
 
 		 665 aa  509  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1023  hypothetical protein  39.16 
 
 		 608 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.318112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0467  hypothetical protein  37.85 
 
 		 617 aa  422  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0466  hypothetical protein  39.37 
 
 		 609 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13130  hypothetical protein  33.53 
 
 		 641 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1184  hypothetical protein  33.24 
 
 		 641 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4424  hypothetical protein  33.53 
 
 		 639 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0792  hypothetical protein  32.32 
 
 		 628 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178452  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0806  hypothetical protein  32.46 
 
 		 628 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0765  hypothetical protein  32.18 
 
 		 628 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0905  hypothetical protein  33.53 
 
 		 597 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1134  hypothetical protein  31.94 
 
 		 597 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1149  hypothetical protein  31.49 
 
 		 645 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19810  hypothetical protein  32.72 
 
 		 585 aa  281  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.177739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0991  hypothetical protein  31.83 
 
 		 645 aa  280  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.868412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4708  hypothetical protein  32.76 
 
 		 629 aa  280  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0952361  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1704  putative lipoprotein  32.31 
 
 		 585 aa  280  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3432  hypothetical protein  32.17 
 
 		 620 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3660  hypothetical protein  30.92 
 
 		 659 aa  276  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2320  hypothetical protein  31.12 
 
 		 606 aa  273  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0224  hypothetical protein  30.65 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3700  hypothetical protein  30.89 
 
 		 617 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0576544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2042  hypothetical protein  30.84 
 
 		 618 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41220  hypothetical protein  30.88 
 
 		 608 aa  258  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0390938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3145  hypothetical protein  32.07 
 
 		 617 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1720  hypothetical protein  31.37 
 
 		 593 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  0.287373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2938  hypothetical protein  30.37 
 
 		 665 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140535  normal  0.820157 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2806  hypothetical protein  28.1 
 
 		 696 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2057  hypothetical protein  30.75 
 
 		 654 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24290  glycine betaine transmethylase  30.85 
 
 		 654 aa  227  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000902449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3167  hypothetical protein  29.97 
 
 		 661 aa  226  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.719833  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1805  hypothetical protein  29.99 
 
 		 682 aa  225  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000127719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2136  hypothetical protein  29.89 
 
 		 682 aa  223  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2695  hypothetical protein  28.43 
 
 		 615 aa  219  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000566517  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1998  hypothetical protein  27.8 
 
 		 688 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000875403  n/a   
 
 
 
NC_009831  Ssed_2480  hypothetical protein  29.38 
 
 		 686 aa  218  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0308258  normal  0.0283529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2628  glycine betaine transmethylase  29.77 
 
 		 649 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2225  hypothetical protein  29.66 
 
 		 682 aa  216  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2437  hypothetical protein  29.66 
 
 		 680 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0176803  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1751  hypothetical protein  28.97 
 
 		 680 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1676  hypothetical protein  29.11 
 
 		 680 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00163825  normal  0.33231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1781  hypothetical protein  28.89 
 
 		 680 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000258085  normal  0.0160925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1588  hypothetical protein  28.41 
 
 		 691 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000609017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1907  protein of unknown function DUF1302  29.52 
 
 		 680 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00456554  normal  0.102822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1938  hypothetical protein  29.89 
 
 		 682 aa  213  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00596375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2557  hypothetical protein  29.38 
 
 		 680 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0938481  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2444  hypothetical protein  29.38 
 
 		 680 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0526018  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2597  hypothetical protein  28.61 
 
 		 680 aa  210  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2199  hypothetical protein  29.1 
 
 		 680 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.812513  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1725  hypothetical protein  28.84 
 
 		 682 aa  206  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000149613  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02007  hypothetical protein  30.53 
 
 		 455 aa  181  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000421467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0162  hypothetical protein  36.39 
 
 		 586 aa  177  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3200  hypothetical protein  26.28 
 
 		 570 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.51508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2972  protein of unknown function DUF1302  24.67 
 
 		 575 aa  130  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.715393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2811  hypothetical protein  29.34 
 
 		 548 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0964  hypothetical protein  30.42 
 
 		 569 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00077396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2750  hypothetical protein  28.21 
 
 		 548 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2166  hypothetical protein  29.85 
 
 		 508 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1511  hypothetical protein  27.81 
 
 		 524 aa  110  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1461  hypothetical protein  27.54 
 
 		 521 aa  108  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890943  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6389  hypothetical protein  29.18 
 
 		 610 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707198  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4324  protein of unknown function DUF1302  29.21 
 
 		 611 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.406766  normal  0.0355116 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4434  protein of unknown function DUF1302  29.21 
 
 		 611 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0662376  normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2582  hypothetical protein  22.29 
 
 		 612 aa  106  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2162  hypothetical protein  27.27 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4059  protein of unknown function DUF1302  25.37 
 
 		 594 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4347  hypothetical protein  29.1 
 
 		 609 aa  100  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6839  hypothetical protein  27.44 
 
 		 613 aa  99.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699678  normal  0.0739476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4360  hypothetical protein  27.82 
 
 		 614 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5041  hypothetical protein  28.03 
 
 		 614 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5819  hypothetical protein  28.03 
 
 		 614 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4864  hypothetical protein  25.89 
 
 		 609 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156964  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0130  hypothetical protein  29.45 
 
 		 557 aa  96.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3919  hypothetical protein  25.98 
 
 		 594 aa  94  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6782  hypothetical protein  26.79 
 
 		 568 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4026  hypothetical protein  25.36 
 
 		 602 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2248  hypothetical protein  32.22 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000224157  decreased coverage  4.957600000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3147  hypothetical protein  22.66 
 
 		 536 aa  82.4  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2669  hypothetical protein  28.16 
 
 		 651 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.575021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6864  hypothetical protein  27.59 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000183389  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2812  hypothetical protein  27.93 
 
 		 651 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0648  hypothetical protein  25 
 
 		 568 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466396  normal  0.419357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>