83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1149 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0792  hypothetical protein  74.85 
 
 		 628 aa  979    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178452  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1704  putative lipoprotein  54.92 
 
 		 585 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13130  hypothetical protein  72.37 
 
 		 641 aa  970    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0806  hypothetical protein  75.61 
 
 		 628 aa  983    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19810  hypothetical protein  55.49 
 
 		 585 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.177739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4424  hypothetical protein  79.22 
 
 		 639 aa  1075    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4708  hypothetical protein  75.23 
 
 		 629 aa  969    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0952361  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1184  hypothetical protein  72.96 
 
 		 641 aa  968    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0905  hypothetical protein  60.06 
 
 		 597 aa  724    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0991  hypothetical protein  97.21 
 
 		 645 aa  1291    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.868412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1149  hypothetical protein  100 
 
 		 645 aa  1318    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1134  hypothetical protein  59.18 
 
 		 597 aa  738    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0765  hypothetical protein  74.85 
 
 		 628 aa  966    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41220  hypothetical protein  56.1 
 
 		 608 aa  722    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0390938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3660  hypothetical protein  61.38 
 
 		 659 aa  788    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0224  hypothetical protein  49.02 
 
 		 603 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1720  hypothetical protein  48.04 
 
 		 593 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  0.287373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3700  hypothetical protein  47.85 
 
 		 617 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0576544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2042  hypothetical protein  47.69 
 
 		 618 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3145  hypothetical protein  45.16 
 
 		 617 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2695  hypothetical protein  42.04 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000566517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3432  hypothetical protein  41.03 
 
 		 620 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2320  hypothetical protein  38.79 
 
 		 606 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2806  hypothetical protein  35.04 
 
 		 696 aa  358  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3167  hypothetical protein  34.96 
 
 		 661 aa  343  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.719833  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1676  hypothetical protein  34 
 
 		 680 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00163825  normal  0.33231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1751  hypothetical protein  34 
 
 		 680 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1781  hypothetical protein  34 
 
 		 680 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000258085  normal  0.0160925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1588  hypothetical protein  33.76 
 
 		 691 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000609017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2597  hypothetical protein  33.76 
 
 		 680 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1938  hypothetical protein  34.41 
 
 		 682 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00596375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1998  hypothetical protein  32.57 
 
 		 688 aa  323  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000875403  n/a   
 
 
 
NC_009665  Shew185_2437  hypothetical protein  33.86 
 
 		 680 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0176803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2557  hypothetical protein  33.72 
 
 		 680 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0938481  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2444  hypothetical protein  33.72 
 
 		 680 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0526018  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2199  hypothetical protein  32.95 
 
 		 680 aa  318  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.812513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1907  protein of unknown function DUF1302  33.72 
 
 		 680 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00456554  normal  0.102822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2480  hypothetical protein  32.61 
 
 		 686 aa  317  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0308258  normal  0.0283529 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1805  hypothetical protein  32.33 
 
 		 682 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000127719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2225  hypothetical protein  32.72 
 
 		 682 aa  307  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2136  hypothetical protein  31.65 
 
 		 682 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1725  hypothetical protein  30.99 
 
 		 682 aa  295  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000149613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2938  hypothetical protein  32.84 
 
 		 665 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140535  normal  0.820157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0087  hypothetical protein  31.49 
 
 		 665 aa  279  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2628  glycine betaine transmethylase  32.8 
 
 		 649 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24290  glycine betaine transmethylase  32.1 
 
 		 654 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000902449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2057  hypothetical protein  32.1 
 
 		 654 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1361  hypothetical protein  31.02 
 
 		 665 aa  260  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0466  hypothetical protein  30.83 
 
 		 609 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0467  hypothetical protein  30.52 
 
 		 617 aa  246  9e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1023  hypothetical protein  30.05 
 
 		 608 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.318112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02007  hypothetical protein  33.7 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000421467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2582  hypothetical protein  25.93 
 
 		 612 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0162  hypothetical protein  26.77 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2972  protein of unknown function DUF1302  26.03 
 
 		 575 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.715393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2750  hypothetical protein  26.19 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4360  hypothetical protein  26.3 
 
 		 614 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5041  hypothetical protein  26.41 
 
 		 614 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5819  hypothetical protein  26.41 
 
 		 614 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4347  hypothetical protein  26.83 
 
 		 609 aa  161  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2811  hypothetical protein  26.15 
 
 		 548 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6389  hypothetical protein  26.43 
 
 		 610 aa  148  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707198  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6839  hypothetical protein  24.47 
 
 		 613 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699678  normal  0.0739476 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6782  hypothetical protein  24.71 
 
 		 568 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4864  hypothetical protein  25.19 
 
 		 609 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156964  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4324  protein of unknown function DUF1302  24.34 
 
 		 611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.406766  normal  0.0355116 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4434  protein of unknown function DUF1302  24.34 
 
 		 611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0662376  normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3200  hypothetical protein  24.22 
 
 		 570 aa  127  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.51508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1511  hypothetical protein  23.94 
 
 		 524 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3147  hypothetical protein  24.01 
 
 		 536 aa  108  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1461  hypothetical protein  23.63 
 
 		 521 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890943  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2166  hypothetical protein  24.71 
 
 		 508 aa  100  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2162  hypothetical protein  21.17 
 
 		 567 aa  90.9  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0964  hypothetical protein  22.26 
 
 		 569 aa  80.9  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00077396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0130  hypothetical protein  22.38 
 
 		 557 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2248  hypothetical protein  28.64 
 
 		 544 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000224157  decreased coverage  4.957600000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6864  hypothetical protein  27.18 
 
 		 565 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000183389  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2669  hypothetical protein  21.59 
 
 		 651 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.575021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2812  hypothetical protein  20.99 
 
 		 651 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3919  hypothetical protein  33.63 
 
 		 594 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4026  hypothetical protein  21.21 
 
 		 602 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4059  protein of unknown function DUF1302  21.73 
 
 		 594 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0648  hypothetical protein  25.66 
 
 		 568 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466396  normal  0.419357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>