83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4708 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0792  hypothetical protein  84.42 
 
 		 628 aa  1110    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178452  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1704  putative lipoprotein  57.99 
 
 		 585 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13130  hypothetical protein  72.87 
 
 		 641 aa  943    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0806  hypothetical protein  84.9 
 
 		 628 aa  1112    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19810  hypothetical protein  58.15 
 
 		 585 aa  676    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.177739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4424  hypothetical protein  75.8 
 
 		 639 aa  981    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4708  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1287    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0952361  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1184  hypothetical protein  72.71 
 
 		 641 aa  936    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0905  hypothetical protein  62.36 
 
 		 597 aa  744    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0991  hypothetical protein  74.47 
 
 		 645 aa  969    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.868412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1149  hypothetical protein  75.23 
 
 		 645 aa  969    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1134  hypothetical protein  63.96 
 
 		 597 aa  777    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0765  hypothetical protein  84.58 
 
 		 628 aa  1093    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41220  hypothetical protein  57.86 
 
 		 608 aa  711    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0390938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3660  hypothetical protein  59.04 
 
 		 659 aa  765    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0224  hypothetical protein  51.81 
 
 		 603 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1720  hypothetical protein  51.53 
 
 		 593 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  0.287373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2042  hypothetical protein  49.77 
 
 		 618 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3700  hypothetical protein  50 
 
 		 617 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0576544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3145  hypothetical protein  47.74 
 
 		 617 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26737  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3432  hypothetical protein  40.99 
 
 		 620 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2695  hypothetical protein  42.45 
 
 		 615 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000566517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2320  hypothetical protein  40.87 
 
 		 606 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2806  hypothetical protein  35.35 
 
 		 696 aa  357  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1588  hypothetical protein  35 
 
 		 691 aa  323  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000609017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2199  hypothetical protein  34.7 
 
 		 680 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.812513  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1676  hypothetical protein  34.37 
 
 		 680 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00163825  normal  0.33231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1781  hypothetical protein  34.51 
 
 		 680 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000258085  normal  0.0160925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2597  hypothetical protein  34.14 
 
 		 680 aa  318  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2437  hypothetical protein  34.65 
 
 		 680 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0176803  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3167  hypothetical protein  33.53 
 
 		 661 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.719833  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1938  hypothetical protein  34.89 
 
 		 682 aa  317  6e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00596375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2557  hypothetical protein  34.94 
 
 		 680 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0938481  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1751  hypothetical protein  34.09 
 
 		 680 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2444  hypothetical protein  34.94 
 
 		 680 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0526018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1805  hypothetical protein  33.66 
 
 		 682 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000127719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1907  protein of unknown function DUF1302  34.94 
 
 		 680 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00456554  normal  0.102822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2480  hypothetical protein  33.43 
 
 		 686 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0308258  normal  0.0283529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2225  hypothetical protein  34.55 
 
 		 682 aa  308  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1998  hypothetical protein  32.48 
 
 		 688 aa  308  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000875403  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_2136  hypothetical protein  32.96 
 
 		 682 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1725  hypothetical protein  32.54 
 
 		 682 aa  295  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000149613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2938  hypothetical protein  32.89 
 
 		 665 aa  289  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140535  normal  0.820157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24290  glycine betaine transmethylase  33.58 
 
 		 654 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000902449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2057  hypothetical protein  33.58 
 
 		 654 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0087  hypothetical protein  32.76 
 
 		 665 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2628  glycine betaine transmethylase  32.7 
 
 		 649 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1361  hypothetical protein  30.64 
 
 		 665 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0466  hypothetical protein  33.18 
 
 		 609 aa  247  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1023  hypothetical protein  32.36 
 
 		 608 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.318112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0467  hypothetical protein  33.07 
 
 		 617 aa  243  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2582  hypothetical protein  26.63 
 
 		 612 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02007  hypothetical protein  32.29 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000421467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0162  hypothetical protein  31.84 
 
 		 586 aa  183  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2750  hypothetical protein  26.64 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2972  protein of unknown function DUF1302  28.27 
 
 		 575 aa  177  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.715393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2811  hypothetical protein  27.38 
 
 		 548 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4360  hypothetical protein  25.26 
 
 		 614 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5041  hypothetical protein  25.26 
 
 		 614 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5819  hypothetical protein  25.26 
 
 		 614 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4347  hypothetical protein  26.69 
 
 		 609 aa  151  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6839  hypothetical protein  25.53 
 
 		 613 aa  150  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699678  normal  0.0739476 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6782  hypothetical protein  25.27 
 
 		 568 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4864  hypothetical protein  27.01 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156964  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4324  protein of unknown function DUF1302  24.76 
 
 		 611 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.406766  normal  0.0355116 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4434  protein of unknown function DUF1302  24.76 
 
 		 611 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0662376  normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6389  hypothetical protein  24.59 
 
 		 610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3200  hypothetical protein  24.84 
 
 		 570 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.51508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1511  hypothetical protein  25.31 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1461  hypothetical protein  24.88 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890943  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2166  hypothetical protein  26.13 
 
 		 508 aa  110  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2162  hypothetical protein  24.57 
 
 		 567 aa  107  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3147  hypothetical protein  27.73 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2248  hypothetical protein  26.14 
 
 		 544 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000224157  decreased coverage  4.957600000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6864  hypothetical protein  24.11 
 
 		 565 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000183389  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0964  hypothetical protein  22.99 
 
 		 569 aa  84.7  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00077396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0130  hypothetical protein  23.6 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2812  hypothetical protein  23.09 
 
 		 651 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2669  hypothetical protein  23.64 
 
 		 651 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.575021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3919  hypothetical protein  26.49 
 
 		 594 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4059  protein of unknown function DUF1302  25.8 
 
 		 594 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4026  hypothetical protein  25.44 
 
 		 602 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0648  hypothetical protein  26.45 
 
 		 568 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466396  normal  0.419357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>