83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1184 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_0792  hypothetical protein  74.73 
 
 
628 aa  987    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178452  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13130  hypothetical protein  98.6 
 
 
641 aa  1307    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19810  hypothetical protein  55.26 
 
 
585 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.177739  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0806  hypothetical protein  74.42 
 
 
628 aa  983    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1704  putative lipoprotein  55.11 
 
 
585 aa  665    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4424  hypothetical protein  75.42 
 
 
639 aa  994    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4708  hypothetical protein  73.18 
 
 
629 aa  951    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0952361  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1184  hypothetical protein  100 
 
 
641 aa  1318    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0905  hypothetical protein  58.13 
 
 
597 aa  714    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0991  hypothetical protein  73.26 
 
 
645 aa  986    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.868412  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1149  hypothetical protein  72.81 
 
 
645 aa  981    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1134  hypothetical protein  59.65 
 
 
597 aa  743    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0765  hypothetical protein  74.11 
 
 
628 aa  976    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3660  hypothetical protein  59.23 
 
 
659 aa  767    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41220  hypothetical protein  56.78 
 
 
608 aa  721    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0390938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0224  hypothetical protein  50.62 
 
 
603 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1720  hypothetical protein  48.74 
 
 
593 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  0.287373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3700  hypothetical protein  47.43 
 
 
617 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0576544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2042  hypothetical protein  47.6 
 
 
618 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3145  hypothetical protein  44.99 
 
 
617 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26737  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2695  hypothetical protein  41.35 
 
 
615 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000566517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2320  hypothetical protein  38.7 
 
 
606 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3432  hypothetical protein  40.49 
 
 
620 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2806  hypothetical protein  33.52 
 
 
696 aa  350  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2437  hypothetical protein  35.19 
 
 
680 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0176803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1676  hypothetical protein  34.33 
 
 
680 aa  342  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00163825  normal  0.33231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1781  hypothetical protein  34.33 
 
 
680 aa  342  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000258085  normal  0.0160925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2557  hypothetical protein  35.19 
 
 
680 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0938481  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2444  hypothetical protein  35.19 
 
 
680 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0526018  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1907  protein of unknown function DUF1302  35.19 
 
 
680 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00456554  normal  0.102822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1588  hypothetical protein  34.18 
 
 
691 aa  339  8e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000609017  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1751  hypothetical protein  33.9 
 
 
680 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2199  hypothetical protein  34.48 
 
 
680 aa  337  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.812513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1805  hypothetical protein  34.18 
 
 
682 aa  334  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000127719  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1938  hypothetical protein  35.76 
 
 
682 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00596375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2597  hypothetical protein  34.24 
 
 
680 aa  332  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3167  hypothetical protein  34.58 
 
 
661 aa  330  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.719833  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2136  hypothetical protein  34.53 
 
 
682 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2480  hypothetical protein  34.56 
 
 
686 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0308258  normal  0.0283529 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1998  hypothetical protein  31.99 
 
 
688 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000875403  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_2225  hypothetical protein  33.82 
 
 
682 aa  317  5e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0087  hypothetical protein  33.71 
 
 
665 aa  309  8e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211464  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1725  hypothetical protein  32.19 
 
 
682 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000149613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2938  hypothetical protein  32.95 
 
 
665 aa  290  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140535  normal  0.820157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24290  glycine betaine transmethylase  32.38 
 
 
654 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000902449  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2057  hypothetical protein  33.18 
 
 
654 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2628  glycine betaine transmethylase  32.41 
 
 
649 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1361  hypothetical protein  31.19 
 
 
665 aa  280  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78358  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0466  hypothetical protein  31.9 
 
 
609 aa  251  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1023  hypothetical protein  31.71 
 
 
608 aa  244  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.318112  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0467  hypothetical protein  31.83 
 
 
617 aa  237  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02007  hypothetical protein  33.03 
 
 
455 aa  210  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000421467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2582  hypothetical protein  26.69 
 
 
612 aa  209  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0162  hypothetical protein  26.01 
 
 
586 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2750  hypothetical protein  26.3 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113257  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2972  protein of unknown function DUF1302  25.43 
 
 
575 aa  164  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.715393  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4360  hypothetical protein  25.85 
 
 
614 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5041  hypothetical protein  25.85 
 
 
614 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5819  hypothetical protein  25.85 
 
 
614 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4347  hypothetical protein  25.89 
 
 
609 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563403  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2811  hypothetical protein  29.45 
 
 
548 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756946  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6839  hypothetical protein  25.22 
 
 
613 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699678  normal  0.0739476 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6389  hypothetical protein  26.43 
 
 
610 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707198  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4864  hypothetical protein  25.7 
 
 
609 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156964  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6782  hypothetical protein  25.63 
 
 
568 aa  147  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4324  protein of unknown function DUF1302  23.34 
 
 
611 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.406766  normal  0.0355116 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4434  protein of unknown function DUF1302  23.34 
 
 
611 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0662376  normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3200  hypothetical protein  25.15 
 
 
570 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.51508  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1511  hypothetical protein  24.66 
 
 
524 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1461  hypothetical protein  27.95 
 
 
521 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890943  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2166  hypothetical protein  26.5 
 
 
508 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3147  hypothetical protein  25.45 
 
 
536 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377982  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2162  hypothetical protein  22.84 
 
 
567 aa  98.6  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0964  hypothetical protein  25.93 
 
 
569 aa  87  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00077396  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2248  hypothetical protein  23.96 
 
 
544 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000224157  decreased coverage  4.957600000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0130  hypothetical protein  21.74 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6864  hypothetical protein  21.82 
 
 
565 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000183389  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2669  hypothetical protein  22.12 
 
 
651 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.575021  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2812  hypothetical protein  21.62 
 
 
651 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229228  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3919  hypothetical protein  28.43 
 
 
594 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0648  hypothetical protein  24.1 
 
 
568 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466396  normal  0.419357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4059  protein of unknown function DUF1302  27.92 
 
 
594 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4026  hypothetical protein  32.48 
 
 
602 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>