83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1805 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2199  hypothetical protein  79.21 
 
 		 680 aa  1147    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.812513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2437  hypothetical protein  79.5 
 
 		 680 aa  1152    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0176803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2480  hypothetical protein  86.44 
 
 		 686 aa  1247    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0308258  normal  0.0283529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1938  hypothetical protein  81.09 
 
 		 682 aa  1176    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00596375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2557  hypothetical protein  79.36 
 
 		 680 aa  1152    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0938481  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1725  hypothetical protein  70.41 
 
 		 682 aa  1037    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000149613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2444  hypothetical protein  79.36 
 
 		 680 aa  1152    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0526018  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1998  hypothetical protein  55.06 
 
 		 688 aa  723    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000875403  n/a   
 
 
 
NC_008321  Shewmr4_1676  hypothetical protein  80.09 
 
 		 680 aa  1159    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00163825  normal  0.33231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2136  hypothetical protein  85.19 
 
 		 682 aa  1228    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1805  hypothetical protein  100 
 
 		 682 aa  1400    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000127719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1751  hypothetical protein  80.09 
 
 		 680 aa  1159    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1781  hypothetical protein  79.8 
 
 		 680 aa  1157    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000258085  normal  0.0160925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2597  hypothetical protein  79.5 
 
 		 680 aa  1153    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2225  hypothetical protein  75.95 
 
 		 682 aa  1106    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2806  hypothetical protein  52.7 
 
 		 696 aa  727    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1907  protein of unknown function DUF1302  79.5 
 
 		 680 aa  1153    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00456554  normal  0.102822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1588  hypothetical protein  77.55 
 
 		 691 aa  1126    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000609017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02007  hypothetical protein  49.35 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000421467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3167  hypothetical protein  35.8 
 
 		 661 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.719833  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13130  hypothetical protein  35.16 
 
 		 641 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1184  hypothetical protein  34.42 
 
 		 641 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3432  hypothetical protein  33.43 
 
 		 620 aa  324  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19810  hypothetical protein  35.87 
 
 		 585 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.177739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4424  hypothetical protein  33 
 
 		 639 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1704  putative lipoprotein  35.56 
 
 		 585 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4708  hypothetical protein  33.66 
 
 		 629 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0952361  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1134  hypothetical protein  34.11 
 
 		 597 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0991  hypothetical protein  32.46 
 
 		 645 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.868412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1149  hypothetical protein  32.33 
 
 		 645 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2695  hypothetical protein  32.61 
 
 		 615 aa  310  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000566517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0806  hypothetical protein  32.02 
 
 		 628 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0792  hypothetical protein  31.12 
 
 		 628 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178452  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0765  hypothetical protein  31.5 
 
 		 628 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0905  hypothetical protein  32.4 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2320  hypothetical protein  31.74 
 
 		 606 aa  294  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0224  hypothetical protein  34.06 
 
 		 603 aa  290  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3700  hypothetical protein  31.08 
 
 		 617 aa  280  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0576544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3145  hypothetical protein  31.57 
 
 		 617 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2042  hypothetical protein  30.44 
 
 		 618 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1720  hypothetical protein  30.56 
 
 		 593 aa  270  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  0.287373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2938  hypothetical protein  31.31 
 
 		 665 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140535  normal  0.820157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3660  hypothetical protein  31.53 
 
 		 659 aa  257  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24290  glycine betaine transmethylase  29.81 
 
 		 654 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000902449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2057  hypothetical protein  29.66 
 
 		 654 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2628  glycine betaine transmethylase  28.87 
 
 		 649 aa  248  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1361  hypothetical protein  28.81 
 
 		 665 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41220  hypothetical protein  28.17 
 
 		 608 aa  225  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0390938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0087  hypothetical protein  29.85 
 
 		 665 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1023  hypothetical protein  30.73 
 
 		 608 aa  217  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.318112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0466  hypothetical protein  28.83 
 
 		 609 aa  211  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0467  hypothetical protein  28.79 
 
 		 617 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0162  hypothetical protein  25.87 
 
 		 586 aa  164  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2972  protein of unknown function DUF1302  26.46 
 
 		 575 aa  160  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.715393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2750  hypothetical protein  25.33 
 
 		 548 aa  144  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1511  hypothetical protein  25.04 
 
 		 524 aa  132  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2811  hypothetical protein  24.96 
 
 		 548 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4864  hypothetical protein  23.94 
 
 		 609 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156964  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6839  hypothetical protein  25.07 
 
 		 613 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699678  normal  0.0739476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5041  hypothetical protein  24.56 
 
 		 614 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5819  hypothetical protein  24.56 
 
 		 614 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3200  hypothetical protein  28.04 
 
 		 570 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.51508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4360  hypothetical protein  24.56 
 
 		 614 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4324  protein of unknown function DUF1302  24.51 
 
 		 611 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.406766  normal  0.0355116 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4434  protein of unknown function DUF1302  24.51 
 
 		 611 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0662376  normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6389  hypothetical protein  24.96 
 
 		 610 aa  109  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707198  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4347  hypothetical protein  23.84 
 
 		 609 aa  109  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1461  hypothetical protein  23.24 
 
 		 521 aa  104  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890943  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6782  hypothetical protein  23.7 
 
 		 568 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3147  hypothetical protein  24.04 
 
 		 536 aa  100  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2582  hypothetical protein  22.35 
 
 		 612 aa  99.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0964  hypothetical protein  24.44 
 
 		 569 aa  98.2  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00077396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2166  hypothetical protein  23.69 
 
 		 508 aa  97.1  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0130  hypothetical protein  28.96 
 
 		 557 aa  84  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2162  hypothetical protein  23.95 
 
 		 567 aa  70.5  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6864  hypothetical protein  21.84 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000183389  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4026  hypothetical protein  30.65 
 
 		 602 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3919  hypothetical protein  30.11 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4059  protein of unknown function DUF1302  29.57 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2248  hypothetical protein  35.78 
 
 		 544 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000224157  decreased coverage  4.957600000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2669  hypothetical protein  25.08 
 
 		 651 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.575021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2812  hypothetical protein  24.75 
 
 		 651 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0648  hypothetical protein  23.55 
 
 		 568 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466396  normal  0.419357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>