83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2972 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2972  protein of unknown function DUF1302  100 
 
 
575 aa  1185    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.715393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2811  hypothetical protein  43.94 
 
 
548 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756946  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2750  hypothetical protein  43.46 
 
 
548 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113257  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6389  hypothetical protein  41.9 
 
 
610 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707198  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4360  hypothetical protein  41.76 
 
 
614 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5819  hypothetical protein  42.08 
 
 
614 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4434  protein of unknown function DUF1302  42.05 
 
 
611 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0662376  normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4347  hypothetical protein  41.68 
 
 
609 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563403  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5041  hypothetical protein  42.08 
 
 
614 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351751  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4324  protein of unknown function DUF1302  42.05 
 
 
611 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.406766  normal  0.0355116 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6839  hypothetical protein  41.56 
 
 
613 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699678  normal  0.0739476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4864  hypothetical protein  41.15 
 
 
609 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156964  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6782  hypothetical protein  39.5 
 
 
568 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0162  hypothetical protein  30.43 
 
 
586 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0792  hypothetical protein  29.21 
 
 
628 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178452  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0806  hypothetical protein  29.52 
 
 
628 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2806  hypothetical protein  26.51 
 
 
696 aa  189  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0765  hypothetical protein  29.06 
 
 
628 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2695  hypothetical protein  29.16 
 
 
615 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000566517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1704  putative lipoprotein  28.83 
 
 
585 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2320  hypothetical protein  27.7 
 
 
606 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19810  hypothetical protein  28.5 
 
 
585 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.177739  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0905  hypothetical protein  28.66 
 
 
597 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4424  hypothetical protein  27.93 
 
 
639 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4708  hypothetical protein  28.27 
 
 
629 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0952361  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1134  hypothetical protein  29.04 
 
 
597 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3145  hypothetical protein  26.51 
 
 
617 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26737  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0991  hypothetical protein  25.73 
 
 
645 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.868412  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1149  hypothetical protein  26.03 
 
 
645 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2225  hypothetical protein  28.87 
 
 
682 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3432  hypothetical protein  27.05 
 
 
620 aa  166  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1720  hypothetical protein  27.68 
 
 
593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  0.287373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1184  hypothetical protein  25.27 
 
 
641 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13130  hypothetical protein  25.27 
 
 
641 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1907  protein of unknown function DUF1302  26.41 
 
 
680 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00456554  normal  0.102822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0224  hypothetical protein  27.8 
 
 
603 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2444  hypothetical protein  26.45 
 
 
680 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0526018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2557  hypothetical protein  26.45 
 
 
680 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0938481  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1998  hypothetical protein  25.33 
 
 
688 aa  161  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000875403  n/a   
 
 
 
NC_009092  Shew_1805  hypothetical protein  26.46 
 
 
682 aa  160  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000127719  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41220  hypothetical protein  27.61 
 
 
608 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0390938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2437  hypothetical protein  26.56 
 
 
680 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0176803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2136  hypothetical protein  25.92 
 
 
682 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02007  hypothetical protein  29.22 
 
 
455 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000421467  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2597  hypothetical protein  27.08 
 
 
680 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2042  hypothetical protein  27.2 
 
 
618 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3700  hypothetical protein  26.86 
 
 
617 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0576544  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2199  hypothetical protein  26.72 
 
 
680 aa  158  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.812513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0466  hypothetical protein  25.79 
 
 
609 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1588  hypothetical protein  26.12 
 
 
691 aa  157  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000609017  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1361  hypothetical protein  26.07 
 
 
665 aa  156  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78358  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1781  hypothetical protein  26.74 
 
 
680 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000258085  normal  0.0160925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1676  hypothetical protein  26.74 
 
 
680 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00163825  normal  0.33231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2480  hypothetical protein  27 
 
 
686 aa  154  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0308258  normal  0.0283529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1938  hypothetical protein  27.27 
 
 
682 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00596375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1751  hypothetical protein  26.44 
 
 
680 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1023  hypothetical protein  24.29 
 
 
608 aa  150  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.318112  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1725  hypothetical protein  27.06 
 
 
682 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000149613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0467  hypothetical protein  24.06 
 
 
617 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3660  hypothetical protein  29.34 
 
 
659 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2938  hypothetical protein  24.96 
 
 
665 aa  140  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140535  normal  0.820157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3167  hypothetical protein  32.28 
 
 
661 aa  136  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.719833  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2057  hypothetical protein  26.43 
 
 
654 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24290  glycine betaine transmethylase  27.25 
 
 
654 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000902449  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0087  hypothetical protein  24.67 
 
 
665 aa  130  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211464  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2628  glycine betaine transmethylase  26.62 
 
 
649 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2162  hypothetical protein  28.54 
 
 
567 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3200  hypothetical protein  26.69 
 
 
570 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.51508  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0130  hypothetical protein  23.05 
 
 
557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1461  hypothetical protein  24.57 
 
 
521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890943  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1511  hypothetical protein  25.54 
 
 
524 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3147  hypothetical protein  27.34 
 
 
536 aa  103  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377982  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2166  hypothetical protein  27.63 
 
 
508 aa  97.8  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2248  hypothetical protein  27.33 
 
 
544 aa  91.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000224157  decreased coverage  4.957600000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0964  hypothetical protein  29.22 
 
 
569 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00077396  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3919  hypothetical protein  27.97 
 
 
594 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6864  hypothetical protein  30.4 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000183389  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4059  protein of unknown function DUF1302  27.38 
 
 
594 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2812  hypothetical protein  24.72 
 
 
651 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229228  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4026  hypothetical protein  25.83 
 
 
602 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2669  hypothetical protein  23.81 
 
 
651 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.575021  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0648  hypothetical protein  25.1 
 
 
568 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466396  normal  0.419357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2582  hypothetical protein  22.34 
 
 
612 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>