82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0648 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0648  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1152    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466396  normal  0.419357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2248  hypothetical protein  36.76 
 
 		 544 aa  339  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000224157  decreased coverage  4.957600000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2162  hypothetical protein  37.87 
 
 		 567 aa  339  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3919  hypothetical protein  31.64 
 
 		 594 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4059  protein of unknown function DUF1302  31.46 
 
 		 594 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4026  hypothetical protein  31.64 
 
 		 602 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2669  hypothetical protein  32.49 
 
 		 651 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.575021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2812  hypothetical protein  32.12 
 
 		 651 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6864  hypothetical protein  30.88 
 
 		 565 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000183389  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0964  hypothetical protein  27.01 
 
 		 569 aa  177  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00077396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0130  hypothetical protein  28.79 
 
 		 557 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3200  hypothetical protein  26.73 
 
 		 570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.51508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3147  hypothetical protein  28.17 
 
 		 536 aa  147  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1461  hypothetical protein  26.67 
 
 		 521 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890943  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1511  hypothetical protein  28.1 
 
 		 524 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2166  hypothetical protein  24.24 
 
 		 508 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1704  putative lipoprotein  28.22 
 
 		 585 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19810  hypothetical protein  27.8 
 
 		 585 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.177739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3432  hypothetical protein  24.67 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2057  hypothetical protein  22.89 
 
 		 654 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24290  glycine betaine transmethylase  23.28 
 
 		 654 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000902449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1023  hypothetical protein  25.81 
 
 		 608 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.318112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2695  hypothetical protein  24.46 
 
 		 615 aa  78.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000566517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0224  hypothetical protein  28.22 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2750  hypothetical protein  23.48 
 
 		 548 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0466  hypothetical protein  25.3 
 
 		 609 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1998  hypothetical protein  23.35 
 
 		 688 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000875403  n/a   
 
 
 
NC_009439  Pmen_2938  hypothetical protein  21.9 
 
 		 665 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140535  normal  0.820157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2972  protein of unknown function DUF1302  25.1 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.715393  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6782  hypothetical protein  23.43 
 
 		 568 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1720  hypothetical protein  23.06 
 
 		 593 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  0.287373 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0467  hypothetical protein  24.62 
 
 		 617 aa  70.5  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02007  hypothetical protein  24.03 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000421467  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4864  hypothetical protein  25.26 
 
 		 609 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156964  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1134  hypothetical protein  25.64 
 
 		 597 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0162  hypothetical protein  24.15 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2811  hypothetical protein  24.11 
 
 		 548 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4347  hypothetical protein  24.82 
 
 		 609 aa  67  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2628  glycine betaine transmethylase  22.26 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2199  hypothetical protein  24.85 
 
 		 680 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.812513  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1751  hypothetical protein  23.52 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1781  hypothetical protein  23.52 
 
 		 680 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000258085  normal  0.0160925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1676  hypothetical protein  23.52 
 
 		 680 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00163825  normal  0.33231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2320  hypothetical protein  20.9 
 
 		 606 aa  64.3  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2597  hypothetical protein  23.24 
 
 		 680 aa  63.9  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3700  hypothetical protein  23.05 
 
 		 617 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0576544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4424  hypothetical protein  30.89 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0792  hypothetical protein  30.89 
 
 		 628 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178452  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0765  hypothetical protein  30.89 
 
 		 628 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0806  hypothetical protein  30.89 
 
 		 628 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4434  protein of unknown function DUF1302  23.17 
 
 		 611 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0662376  normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4324  protein of unknown function DUF1302  23.17 
 
 		 611 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.406766  normal  0.0355116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0087  hypothetical protein  25 
 
 		 665 aa  62.4  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2437  hypothetical protein  24.32 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0176803  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1184  hypothetical protein  27.81 
 
 		 641 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13130  hypothetical protein  23.74 
 
 		 641 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2042  hypothetical protein  23.27 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1907  protein of unknown function DUF1302  24.32 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00456554  normal  0.102822 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2557  hypothetical protein  23.36 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0938481  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2444  hypothetical protein  23.36 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0526018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3660  hypothetical protein  31.3 
 
 		 659 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0905  hypothetical protein  21.85 
 
 		 597 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2806  hypothetical protein  23.49 
 
 		 696 aa  57.4  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4708  hypothetical protein  26.45 
 
 		 629 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0952361  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41220  hypothetical protein  28.46 
 
 		 608 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0390938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3145  hypothetical protein  24.61 
 
 		 617 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0991  hypothetical protein  25.98 
 
 		 645 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.868412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6839  hypothetical protein  21.72 
 
 		 613 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699678  normal  0.0739476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1805  hypothetical protein  23.55 
 
 		 682 aa  55.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000127719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1149  hypothetical protein  25.66 
 
 		 645 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6389  hypothetical protein  22.44 
 
 		 610 aa  54.3  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707198  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4360  hypothetical protein  23.61 
 
 		 614 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5041  hypothetical protein  23.61 
 
 		 614 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2136  hypothetical protein  23.79 
 
 		 682 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1361  hypothetical protein  29.73 
 
 		 665 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5819  hypothetical protein  23.61 
 
 		 614 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2480  hypothetical protein  23.55 
 
 		 686 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0308258  normal  0.0283529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2225  hypothetical protein  32.71 
 
 		 682 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3167  hypothetical protein  26.11 
 
 		 661 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.719833  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1588  hypothetical protein  32.11 
 
 		 691 aa  51.6  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000609017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1938  hypothetical protein  26.74 
 
 		 682 aa  50.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00596375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1725  hypothetical protein  23 
 
 		 682 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000149613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>