83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0765 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_0792  hypothetical protein  99.36 
 
 
628 aa  1284    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178452  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1704  putative lipoprotein  57.1 
 
 
585 aa  665    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13130  hypothetical protein  74.42 
 
 
641 aa  978    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0806  hypothetical protein  97.13 
 
 
628 aa  1264    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19810  hypothetical protein  57.42 
 
 
585 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.177739  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4424  hypothetical protein  78.46 
 
 
639 aa  1020    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4708  hypothetical protein  84.58 
 
 
629 aa  1110    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0952361  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1184  hypothetical protein  74.11 
 
 
641 aa  970    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0905  hypothetical protein  61.58 
 
 
597 aa  737    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0991  hypothetical protein  74.85 
 
 
645 aa  982    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.868412  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1149  hypothetical protein  74.7 
 
 
645 aa  976    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1134  hypothetical protein  62.7 
 
 
597 aa  766    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0765  hypothetical protein  100 
 
 
628 aa  1290    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41220  hypothetical protein  59.58 
 
 
608 aa  729    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0390938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3660  hypothetical protein  58.25 
 
 
659 aa  761    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0224  hypothetical protein  51.72 
 
 
603 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1720  hypothetical protein  50.72 
 
 
593 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  0.287373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2042  hypothetical protein  48.43 
 
 
618 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3700  hypothetical protein  48.43 
 
 
617 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0576544  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3145  hypothetical protein  45.61 
 
 
617 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26737  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2695  hypothetical protein  44.6 
 
 
615 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000566517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3432  hypothetical protein  43.06 
 
 
620 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2320  hypothetical protein  40.5 
 
 
606 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2806  hypothetical protein  34.7 
 
 
696 aa  360  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2199  hypothetical protein  33.52 
 
 
680 aa  334  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.812513  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1676  hypothetical protein  33.38 
 
 
680 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00163825  normal  0.33231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1751  hypothetical protein  33.38 
 
 
680 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1781  hypothetical protein  33.38 
 
 
680 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000258085  normal  0.0160925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2597  hypothetical protein  33.24 
 
 
680 aa  330  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2437  hypothetical protein  34.13 
 
 
680 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0176803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1907  protein of unknown function DUF1302  34.13 
 
 
680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00456554  normal  0.102822 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2557  hypothetical protein  34.13 
 
 
680 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0938481  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2444  hypothetical protein  34.13 
 
 
680 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0526018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3167  hypothetical protein  34.42 
 
 
661 aa  327  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.719833  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1588  hypothetical protein  33.85 
 
 
691 aa  327  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000609017  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1998  hypothetical protein  33.24 
 
 
688 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000875403  n/a   
 
 
 
NC_009831  Ssed_2480  hypothetical protein  33.33 
 
 
686 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0308258  normal  0.0283529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2225  hypothetical protein  33.24 
 
 
682 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2136  hypothetical protein  32.61 
 
 
682 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1938  hypothetical protein  33.38 
 
 
682 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00596375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1805  hypothetical protein  31.5 
 
 
682 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000127719  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1725  hypothetical protein  31.87 
 
 
682 aa  301  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000149613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2938  hypothetical protein  32.27 
 
 
665 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140535  normal  0.820157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0087  hypothetical protein  32.03 
 
 
665 aa  285  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211464  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1361  hypothetical protein  32.39 
 
 
665 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78358  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24290  glycine betaine transmethylase  32.55 
 
 
654 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000902449  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2057  hypothetical protein  32.55 
 
 
654 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2628  glycine betaine transmethylase  32.31 
 
 
649 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0466  hypothetical protein  33.81 
 
 
609 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1023  hypothetical protein  32.56 
 
 
608 aa  249  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.318112  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0467  hypothetical protein  32.29 
 
 
617 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2582  hypothetical protein  27.69 
 
 
612 aa  216  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02007  hypothetical protein  32.51 
 
 
455 aa  204  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000421467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0162  hypothetical protein  26.98 
 
 
586 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2972  protein of unknown function DUF1302  29.68 
 
 
575 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.715393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2750  hypothetical protein  26.99 
 
 
548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113257  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2811  hypothetical protein  26.98 
 
 
548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756946  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4347  hypothetical protein  26.81 
 
 
609 aa  165  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563403  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5041  hypothetical protein  26.22 
 
 
614 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5819  hypothetical protein  26.22 
 
 
614 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4360  hypothetical protein  26.07 
 
 
614 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6782  hypothetical protein  25.79 
 
 
568 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4864  hypothetical protein  26.01 
 
 
609 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156964  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6389  hypothetical protein  26.18 
 
 
610 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707198  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6839  hypothetical protein  24.41 
 
 
613 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699678  normal  0.0739476 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4324  protein of unknown function DUF1302  23.59 
 
 
611 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.406766  normal  0.0355116 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4434  protein of unknown function DUF1302  23.59 
 
 
611 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0662376  normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3200  hypothetical protein  28.71 
 
 
570 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.51508  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1511  hypothetical protein  25.35 
 
 
524 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1461  hypothetical protein  24.96 
 
 
521 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890943  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2162  hypothetical protein  24.45 
 
 
567 aa  111  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2166  hypothetical protein  26.6 
 
 
508 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3147  hypothetical protein  27.96 
 
 
536 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377982  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6864  hypothetical protein  24.73 
 
 
565 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000183389  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0964  hypothetical protein  25.93 
 
 
569 aa  96.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00077396  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0130  hypothetical protein  25.47 
 
 
557 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2248  hypothetical protein  25.41 
 
 
544 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000224157  decreased coverage  4.957600000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2669  hypothetical protein  23.11 
 
 
651 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.575021  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2812  hypothetical protein  23.11 
 
 
651 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229228  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3919  hypothetical protein  29.28 
 
 
594 aa  73.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4059  protein of unknown function DUF1302  25.1 
 
 
594 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4026  hypothetical protein  23.96 
 
 
602 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0648  hypothetical protein  30.89 
 
 
568 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466396  normal  0.419357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>