83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2557 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2199  hypothetical protein  94.41 
 
 
680 aa  1338    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.812513  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1751  hypothetical protein  90.59 
 
 
680 aa  1300    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1676  hypothetical protein  91.03 
 
 
680 aa  1305    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00163825  normal  0.33231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1998  hypothetical protein  53.04 
 
 
688 aa  700    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000875403  n/a   
 
 
 
NC_007954  Sden_1725  hypothetical protein  73.28 
 
 
682 aa  1070    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000149613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2225  hypothetical protein  80.56 
 
 
682 aa  1152    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2437  hypothetical protein  99.56 
 
 
680 aa  1390    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0176803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2480  hypothetical protein  77.44 
 
 
686 aa  1120    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0308258  normal  0.0283529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1938  hypothetical protein  79.21 
 
 
682 aa  1139    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00596375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2557  hypothetical protein  100 
 
 
680 aa  1396    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0938481  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2136  hypothetical protein  77.75 
 
 
682 aa  1123    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1781  hypothetical protein  91.03 
 
 
680 aa  1305    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000258085  normal  0.0160925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1588  hypothetical protein  80.64 
 
 
691 aa  1149    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000609017  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2444  hypothetical protein  100 
 
 
680 aa  1396    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0526018  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2597  hypothetical protein  91.18 
 
 
680 aa  1302    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1805  hypothetical protein  79.36 
 
 
682 aa  1152    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000127719  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2806  hypothetical protein  52.22 
 
 
696 aa  712    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1907  protein of unknown function DUF1302  99.71 
 
 
680 aa  1394    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00456554  normal  0.102822 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02007  hypothetical protein  46.1 
 
 
455 aa  405  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000421467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13130  hypothetical protein  35.24 
 
 
641 aa  343  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1184  hypothetical protein  34.76 
 
 
641 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4424  hypothetical protein  35.16 
 
 
639 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3167  hypothetical protein  34.89 
 
 
661 aa  333  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.719833  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0792  hypothetical protein  34.27 
 
 
628 aa  330  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178452  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0806  hypothetical protein  33.99 
 
 
628 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0765  hypothetical protein  34.13 
 
 
628 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19810  hypothetical protein  35.55 
 
 
585 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.177739  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0991  hypothetical protein  33.91 
 
 
645 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.868412  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1704  putative lipoprotein  35.25 
 
 
585 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1149  hypothetical protein  33.72 
 
 
645 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3432  hypothetical protein  34.33 
 
 
620 aa  317  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4708  hypothetical protein  34.94 
 
 
629 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0952361  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2695  hypothetical protein  33.48 
 
 
615 aa  313  9e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000566517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0905  hypothetical protein  33.28 
 
 
597 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1134  hypothetical protein  32.5 
 
 
597 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3660  hypothetical protein  33.75 
 
 
659 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0224  hypothetical protein  33.43 
 
 
603 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2320  hypothetical protein  28.89 
 
 
606 aa  278  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2042  hypothetical protein  30.68 
 
 
618 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3700  hypothetical protein  30.43 
 
 
617 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0576544  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1720  hypothetical protein  29.82 
 
 
593 aa  267  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  0.287373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2938  hypothetical protein  29.6 
 
 
665 aa  266  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140535  normal  0.820157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24290  glycine betaine transmethylase  31.64 
 
 
654 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000902449  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2057  hypothetical protein  31.48 
 
 
654 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2628  glycine betaine transmethylase  30.23 
 
 
649 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3145  hypothetical protein  29.64 
 
 
617 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26737  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41220  hypothetical protein  29.97 
 
 
608 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0390938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1361  hypothetical protein  28.41 
 
 
665 aa  235  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78358  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0467  hypothetical protein  30.46 
 
 
617 aa  227  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1023  hypothetical protein  31.3 
 
 
608 aa  222  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.318112  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0466  hypothetical protein  28.43 
 
 
609 aa  216  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0087  hypothetical protein  29.38 
 
 
665 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211464  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0162  hypothetical protein  26.67 
 
 
586 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2972  protein of unknown function DUF1302  26.45 
 
 
575 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.715393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2811  hypothetical protein  25 
 
 
548 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756946  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4864  hypothetical protein  25.66 
 
 
609 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156964  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1511  hypothetical protein  24.92 
 
 
524 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4347  hypothetical protein  25.37 
 
 
609 aa  125  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0563403  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4360  hypothetical protein  25.6 
 
 
614 aa  122  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5819  hypothetical protein  25.45 
 
 
614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5041  hypothetical protein  25.45 
 
 
614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.351751  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6839  hypothetical protein  25.27 
 
 
613 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0699678  normal  0.0739476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2750  hypothetical protein  30.59 
 
 
548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113257  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2582  hypothetical protein  23.42 
 
 
612 aa  109  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6782  hypothetical protein  31.37 
 
 
568 aa  108  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4434  protein of unknown function DUF1302  25.3 
 
 
611 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0662376  normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4324  protein of unknown function DUF1302  25.3 
 
 
611 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.406766  normal  0.0355116 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6389  hypothetical protein  24.35 
 
 
610 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3200  hypothetical protein  25.34 
 
 
570 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.51508  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3147  hypothetical protein  21.99 
 
 
536 aa  94.7  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377982  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1461  hypothetical protein  22.75 
 
 
521 aa  92.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890943  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0964  hypothetical protein  23.67 
 
 
569 aa  90.1  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00077396  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2166  hypothetical protein  26.06 
 
 
508 aa  87.4  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0130  hypothetical protein  24.48 
 
 
557 aa  83.2  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2162  hypothetical protein  21.93 
 
 
567 aa  71.2  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2669  hypothetical protein  23.75 
 
 
651 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.575021  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2812  hypothetical protein  25.77 
 
 
651 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229228  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3919  hypothetical protein  37.61 
 
 
594 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4026  hypothetical protein  28.64 
 
 
602 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0648  hypothetical protein  23.36 
 
 
568 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466396  normal  0.419357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4059  protein of unknown function DUF1302  35.45 
 
 
594 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2248  hypothetical protein  33.94 
 
 
544 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000000224157  decreased coverage  4.957600000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6864  hypothetical protein  28.68 
 
 
565 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000183389  normal  0.106911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>