More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4138 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4138  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  475  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00689638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2920  transcriptional regulator GntR  68.64 
 
 		 239 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.430067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18050  transcriptional regulator, GntR family  51.74 
 
 		 232 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15140  transcriptional regulator  47.03 
 
 		 239 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2284  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  28.39 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2920  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 244 aa  62  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5851  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3363  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.638861 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.28 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  24.43 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5096  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4736  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4971  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4999  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4576  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4595  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0264  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  45.16 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4984  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4956  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  27.75 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  34.23 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4685  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  24.29 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  25.34 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2059  transcription regulator, GntR family  25.69 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  27.15 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  33.59 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  32.31 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.31 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5900  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.540308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3001  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  37.37 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1763  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.102189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6056  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00777479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  31.51 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  29.11 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  29.12 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.48 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  40.98 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  40.98 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  42.65 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  25.31 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  39.76 
 
 		 256 aa  52  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  42.03 
 
 		 285 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4638  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  31.78 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>