142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1299 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  51.01 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  64.1 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  58.67 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  43.84 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  52.87 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  53.16 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  53.16 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  51.27 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  46.24 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  45.83 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  45.83 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  40.82 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  44.51 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  41.36 
 
 		 290 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  43.11 
 
 		 315 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  53.68 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  41.21 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  41.95 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  53.55 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4289  hypothetical protein  43.02 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  50.72 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  40.27 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3992  hypothetical protein  42.55 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  43.75 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  48.92 
 
 		 315 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  41.62 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  41.62 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  45.03 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  46.3 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  34.25 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  41.48 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  48.51 
 
 		 166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3453  hypothetical protein  55.65 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529474  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  42.21 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  42.44 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  43.92 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  43.92 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  38.03 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  43.92 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  43.92 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  43.92 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  43.92 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  36.87 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  44.22 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  44.59 
 
 		 259 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  39.06 
 
 		 285 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  44.9 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  43.33 
 
 		 302 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  41.95 
 
 		 283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  35.68 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  38.15 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  41.57 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  36.87 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  40 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  38.89 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  39.52 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  38.24 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  36.22 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  41.61 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  37.61 
 
 		 290 aa  118  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  45.86 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  39.41 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  34.76 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  41.61 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  32.57 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  45.8 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  41.83 
 
 		 341 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  35.2 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  44.83 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  43.17 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  34.84 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  35.4 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  34.25 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  37.76 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  41.35 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  39.35 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  34.16 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  34.91 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  33.7 
 
 		 309 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_002950  PG0361  hypothetical protein  40.15 
 
 		 435 aa  102  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.343727 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  32.51 
 
 		 386 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  32.02 
 
 		 389 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  29.26 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  35.46 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  38.26 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  32.91 
 
 		 422 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04780  hypothetical protein  34.88 
 
 		 267 aa  99  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  35 
 
 		 313 aa  99  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  35.17 
 
 		 419 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  29.61 
 
 		 288 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1889  hypothetical protein  32.12 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  36.91 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  35 
 
 		 306 aa  96.3  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0875  protein of unknown function DUF477  33.17 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000594367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  34.64 
 
 		 294 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  33.58 
 
 		 440 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  35.8 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>