137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5308 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  100 
 
 		 293 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  100 
 
 		 286 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  63.92 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  64.09 
 
 		 277 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  66.94 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  62.62 
 
 		 283 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  56.25 
 
 		 286 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  56.83 
 
 		 292 aa  255  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  58.33 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  50.2 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  60.66 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  62.22 
 
 		 284 aa  238  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  60.42 
 
 		 282 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  60.42 
 
 		 282 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  60.42 
 
 		 282 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  60.42 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  60.42 
 
 		 282 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  60 
 
 		 282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  53.67 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  56.16 
 
 		 295 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  52.19 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  47.77 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  51.34 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  55.22 
 
 		 320 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  53.3 
 
 		 301 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  50.9 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  51.09 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  52.33 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  56.34 
 
 		 288 aa  175  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  49.74 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  43.58 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  45.69 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  44.75 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2520  protein of unknown function DUF477  44.86 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  57.55 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  57.55 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  41.35 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  41.44 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  44.16 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  53.62 
 
 		 440 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  42.78 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  52.9 
 
 		 453 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  49.02 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  41.09 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  40.1 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  46.45 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  40.18 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  49.64 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  43.24 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0380  hypothetical protein  40.64 
 
 		 313 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  40.74 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  44.81 
 
 		 419 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  48.92 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  45.41 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  40.44 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  42.08 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  39.62 
 
 		 250 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  46.21 
 
 		 422 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  35.45 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0315  hypothetical protein  50 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.929741  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  48.92 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  44.59 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0310  protein of unknown function DUF477  50 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176101  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  42.94 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  43.2 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  42.59 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  44.71 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  43.2 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  39.9 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  43.05 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  45.21 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  47.79 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  38.86 
 
 		 256 aa  126  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  43.33 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  42.68 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  49.24 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  43.33 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  40.38 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  43.26 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  41.84 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  38.89 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  39.39 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  46.81 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  39.05 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  40.24 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  37.95 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  32.1 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  37.65 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  37.65 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  37.65 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  33.19 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  38.14 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  41.21 
 
 		 262 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  34.83 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  41.91 
 
 		 229 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  37.18 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  36.42 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  44.44 
 
 		 166 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  41.3 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  36 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>