139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0454 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  764    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  92.13 
 
 
386 aa  623  1e-177  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  58.84 
 
 
396 aa  346  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  36.89 
 
 
288 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  37.79 
 
 
301 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  37.02 
 
 
283 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  40.12 
 
 
264 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  37.77 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  34.93 
 
 
285 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  38.27 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  37.17 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  38.53 
 
 
286 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  38.3 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  36.27 
 
 
301 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  36.32 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  35.32 
 
 
292 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  37.5 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  33.94 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  36.04 
 
 
281 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  37.97 
 
 
336 aa  111  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  35.05 
 
 
419 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  38.95 
 
 
299 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  37.5 
 
 
282 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  41.72 
 
 
343 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  36.93 
 
 
282 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  45.11 
 
 
341 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  39.06 
 
 
267 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  36.93 
 
 
282 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  35.91 
 
 
293 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  36.93 
 
 
282 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  36.93 
 
 
282 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  36.93 
 
 
282 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  36.93 
 
 
282 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  39.06 
 
 
266 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  45.67 
 
 
440 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  35.91 
 
 
286 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  37.8 
 
 
256 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  40.12 
 
 
315 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  36.52 
 
 
284 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  37.57 
 
 
306 aa  106  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  43.09 
 
 
283 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  35.8 
 
 
422 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  34.05 
 
 
290 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  45.9 
 
 
453 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  36.11 
 
 
295 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  36.13 
 
 
290 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  31.58 
 
 
285 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  36.27 
 
 
314 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  40.65 
 
 
320 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5849  protein of unknown function DUF477  37.06 
 
 
282 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.522543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  39.26 
 
 
290 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  40.48 
 
 
288 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  34.07 
 
 
299 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  33.52 
 
 
256 aa  100  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  32.49 
 
 
305 aa  100  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  39.13 
 
 
271 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  35 
 
 
270 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  39.85 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  39.26 
 
 
290 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  39.26 
 
 
290 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  32.66 
 
 
287 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  39.1 
 
 
281 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  39.26 
 
 
290 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  39.26 
 
 
242 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  30.85 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  39.34 
 
 
235 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  35.36 
 
 
274 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  33.51 
 
 
290 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  40.46 
 
 
315 aa  94.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0315  hypothetical protein  37.16 
 
 
300 aa  93.6  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.929741  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  32.02 
 
 
250 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0310  protein of unknown function DUF477  37.16 
 
 
302 aa  93.2  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  37.78 
 
 
290 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  34.43 
 
 
288 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  31.21 
 
 
260 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  38.97 
 
 
315 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  32.7 
 
 
287 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  35.9 
 
 
265 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  38.35 
 
 
260 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  34.5 
 
 
279 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  32.81 
 
 
287 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  30.1 
 
 
284 aa  90.5  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  38.58 
 
 
259 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  35.9 
 
 
253 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  37.58 
 
 
251 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  37.6 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  37.78 
 
 
294 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  34.53 
 
 
262 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  37.69 
 
 
423 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  32.28 
 
 
266 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3702  hypothetical protein  34.57 
 
 
266 aa  86.7  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83448  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  37.3 
 
 
166 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  31.41 
 
 
258 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  34.92 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  34.92 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  33.15 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  36.99 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  29.71 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1517  hypothetical protein  35.15 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413483  normal  0.437621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  33.56 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>