140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2527 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  506  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  51.12 
 
 		 264 aa  207  9e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  49.42 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  39.74 
 
 		 315 aa  150  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  52.35 
 
 		 290 aa  148  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  43.23 
 
 		 299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  40.68 
 
 		 315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  49.67 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  47.18 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  50 
 
 		 287 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  45.14 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  46.05 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  49.34 
 
 		 288 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  41.01 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  41.49 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  47.01 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  39.11 
 
 		 336 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  46.85 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  47.86 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  40.23 
 
 		 293 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  40.23 
 
 		 286 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  42.53 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  44.59 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  48.84 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  42.76 
 
 		 295 aa  128  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  45.8 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  38.71 
 
 		 292 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  47.73 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  44 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  39.56 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  41.89 
 
 		 283 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  37.23 
 
 		 283 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  42.47 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  46.04 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  47.29 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  41.14 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  41.14 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  35.64 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  47.33 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  48.09 
 
 		 290 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  42.54 
 
 		 284 aa  122  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  46.51 
 
 		 302 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  35.29 
 
 		 274 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  40.23 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  38.93 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  45.74 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  46.15 
 
 		 261 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  46.15 
 
 		 261 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  48.8 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  46.88 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  45.24 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  45.38 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  39.86 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  46.15 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  46.03 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  44.44 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  37.5 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  40.54 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  44.44 
 
 		 282 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  44.44 
 
 		 282 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  44.44 
 
 		 282 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  44.44 
 
 		 282 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  38.14 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  36.47 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  39.19 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  39.19 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  41.72 
 
 		 386 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  41.06 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  39.19 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  39.19 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  43.61 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  42.31 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  39.53 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  43.9 
 
 		 440 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  34.15 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  34.34 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  38.04 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  38.37 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  43.14 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  34.44 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  37.72 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  42.4 
 
 		 453 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  42 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  37.35 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  41.8 
 
 		 281 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  39.74 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  43.41 
 
 		 166 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  37.98 
 
 		 389 aa  109  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  37.84 
 
 		 290 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  40.71 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  37.42 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  40.29 
 
 		 396 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  41.13 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  40.62 
 
 		 423 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  32.37 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1517  hypothetical protein  38.69 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413483  normal  0.437621 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0913  protein of unknown function DUF477  45.24 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  37.25 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1459  hypothetical protein  42.28 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000468004  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  36.64 
 
 		 290 aa  98.6  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>