137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0424 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  552  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  54.7 
 
 		 309 aa  241  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0380  hypothetical protein  59.75 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  52.05 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  54.46 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  55.92 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0315  hypothetical protein  60 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.929741  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0310  protein of unknown function DUF477  60 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  52.51 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2520  protein of unknown function DUF477  50.88 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  51.44 
 
 		 313 aa  201  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  45.04 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  46.06 
 
 		 285 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  41.37 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  43.39 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  42.5 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  42.8 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  41.41 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  42.48 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  42.67 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  40.52 
 
 		 283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  46.93 
 
 		 295 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  40.64 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  46.22 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  41.88 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  41.88 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  39.21 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  42.64 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  44.19 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  41.56 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  41.3 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  44.06 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  47.56 
 
 		 282 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  43.19 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  46.34 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  46.34 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  46.34 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  46.34 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  46.34 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  41.58 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  47.37 
 
 		 419 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  47.59 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  43.56 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  46.36 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  46.62 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  50.35 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  50.35 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  50.35 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  48.95 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  41.01 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  49.28 
 
 		 453 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  37.17 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  35.67 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  35.59 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  33.86 
 
 		 389 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  33.86 
 
 		 386 aa  112  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  36.98 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  42.31 
 
 		 423 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  35.14 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  34.86 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  36.08 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  37.84 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  36.42 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  29.03 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  27.8 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  27.8 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  31.25 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  36.21 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  30.46 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  33.88 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  32.53 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  39.86 
 
 		 166 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  36.81 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  31.36 
 
 		 250 aa  99.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  34.94 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  27.65 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  26.42 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  36.11 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  31.58 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  35.62 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  31.01 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  28.37 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  36.92 
 
 		 256 aa  95.5  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  36.3 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  31.65 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  31.65 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  31.65 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  31.65 
 
 		 242 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  31.65 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  35.56 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  34.81 
 
 		 262 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  31.67 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  31.74 
 
 		 229 aa  92.4  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  29.59 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  33.97 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  36.76 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  28.47 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1459  hypothetical protein  33.54 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000468004  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  31.79 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  27.32 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>