139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4545 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  560  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  60.34 
 
 
285 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  58.02 
 
 
292 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  55.67 
 
 
283 aa  261  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  55.51 
 
 
288 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  56.22 
 
 
293 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  56.22 
 
 
286 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  55.96 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  53.14 
 
 
290 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  55.35 
 
 
301 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  46.22 
 
 
295 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  52.72 
 
 
283 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  50.8 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  49.8 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  53.88 
 
 
284 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  50.82 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  50.41 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  50.41 
 
 
282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  50.41 
 
 
282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  50.41 
 
 
282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  50.41 
 
 
282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  51.29 
 
 
307 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  54.08 
 
 
301 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  46.36 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  45.23 
 
 
320 aa  195  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  47.32 
 
 
287 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  54.72 
 
 
341 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  49.75 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  51.9 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  40.54 
 
 
314 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  51.45 
 
 
287 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  42.05 
 
 
274 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  54.68 
 
 
453 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  41.87 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  45.37 
 
 
279 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  45.73 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  45.33 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2520  protein of unknown function DUF477  45.09 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  53.24 
 
 
440 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  50.7 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  40.43 
 
 
309 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  38.83 
 
 
288 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  51.43 
 
 
288 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  43.78 
 
 
305 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  42.8 
 
 
290 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  40.08 
 
 
422 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  38.4 
 
 
419 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  37.88 
 
 
313 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  42.01 
 
 
315 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  42.62 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  43.37 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  44.14 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  41.47 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0380  hypothetical protein  46.75 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0315  hypothetical protein  49.38 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.929741  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  42.94 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0310  protein of unknown function DUF477  49.38 
 
 
302 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176101  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  41.07 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  35.39 
 
 
287 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  41.82 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  43.54 
 
 
301 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  42.47 
 
 
256 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  41.25 
 
 
297 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  40.72 
 
 
299 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  41.56 
 
 
259 aa  122  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  41.98 
 
 
302 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  42.76 
 
 
237 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  38.41 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  47.69 
 
 
423 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  42.36 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  42.36 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  38.55 
 
 
267 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  38.55 
 
 
266 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  38.89 
 
 
299 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  43.06 
 
 
294 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  46.88 
 
 
264 aa  119  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  37.9 
 
 
386 aa  119  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  43.7 
 
 
262 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  45.19 
 
 
253 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  33.74 
 
 
288 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  36.08 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  37.44 
 
 
389 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  40.56 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  38.78 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  41.18 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  41.94 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  39.46 
 
 
290 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  39.46 
 
 
290 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  39.46 
 
 
242 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  39.46 
 
 
290 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  35.85 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  41.43 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  38.1 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  37.91 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  36.84 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  41.98 
 
 
166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  30.43 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  34.84 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  37.79 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  34.6 
 
 
396 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>