138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1255 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  100 
 
 
302 aa  586  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  45.37 
 
 
287 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  45.23 
 
 
290 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  44.91 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  46.39 
 
 
285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  48.5 
 
 
256 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  46.92 
 
 
299 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  52.7 
 
 
259 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  44.77 
 
 
246 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  48.47 
 
 
235 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  45.61 
 
 
260 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  44.02 
 
 
250 aa  152  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  45.16 
 
 
246 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  46.1 
 
 
229 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  43.1 
 
 
315 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  36.29 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  37.65 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  43.75 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  45.16 
 
 
315 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  46.62 
 
 
256 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  36.14 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  40 
 
 
267 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  40 
 
 
266 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  47.79 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  42.86 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  41.72 
 
 
299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  44.44 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  45.93 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  44.93 
 
 
315 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  39.88 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  39.88 
 
 
282 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  39.26 
 
 
282 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  35.36 
 
 
285 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  36.24 
 
 
287 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  39.26 
 
 
282 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  39.76 
 
 
284 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  39.26 
 
 
282 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  39.26 
 
 
282 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  39.26 
 
 
282 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  39.52 
 
 
260 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  41.55 
 
 
287 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  40.96 
 
 
286 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  38.1 
 
 
320 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  41.84 
 
 
293 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  41.84 
 
 
286 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  45.8 
 
 
264 aa  123  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  45.93 
 
 
253 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  37.06 
 
 
266 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  37.56 
 
 
287 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  36.79 
 
 
260 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  42.96 
 
 
283 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  35.98 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  41.07 
 
 
277 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  35.09 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  46.85 
 
 
166 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  42.25 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  36.29 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  33.5 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  45.93 
 
 
261 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  45.93 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  45.19 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  44.06 
 
 
237 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  37 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2520  protein of unknown function DUF477  44.14 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  41.55 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  36.65 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  43.06 
 
 
341 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  37.71 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  34.25 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  41.13 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  38.71 
 
 
284 aa  113  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  36.51 
 
 
305 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  40.58 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  38.52 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  43.41 
 
 
423 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  34.2 
 
 
306 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  29.32 
 
 
297 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1889  hypothetical protein  35.5 
 
 
272 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  39.24 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  42.6 
 
 
269 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  41.04 
 
 
290 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  39.86 
 
 
314 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  33.17 
 
 
274 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  40.88 
 
 
453 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  35.71 
 
 
279 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  35.68 
 
 
294 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  34.94 
 
 
288 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  39.49 
 
 
238 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  37.76 
 
 
288 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  41.54 
 
 
251 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  30.92 
 
 
301 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  34.93 
 
 
313 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  38.52 
 
 
281 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  38.69 
 
 
440 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  28.24 
 
 
422 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  37.04 
 
 
290 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0380  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  32.43 
 
 
294 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3702  hypothetical protein  32.56 
 
 
266 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83448  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5849  protein of unknown function DUF477  34.84 
 
 
282 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.522543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>