142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1230 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  100 
 
 		 294 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  70.52 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  50.25 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  57.79 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  56.88 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  56.67 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  56.67 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  49.75 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  56 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  48.4 
 
 		 299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  48.4 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  48.4 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  52.76 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  39.6 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  50.31 
 
 		 251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  46.31 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  41.88 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  52.63 
 
 		 237 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  39.6 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  42.05 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  48.89 
 
 		 250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  45.39 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  40.21 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  38.38 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  41.07 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  44.23 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3453  hypothetical protein  46.37 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529474  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  41.52 
 
 		 279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  46.21 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  38.89 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  44.83 
 
 		 343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  40 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  40.48 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  47.1 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  36.14 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  46.92 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  46.72 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  42.95 
 
 		 246 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  41.33 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  38.18 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  38.97 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  38.98 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  42.76 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  39.58 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  40.94 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  33.74 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  42.55 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  41.25 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  41.25 
 
 		 286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  41.51 
 
 		 260 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  35.32 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  37.63 
 
 		 287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  39.19 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  41.79 
 
 		 419 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  37.71 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  38.25 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  41.22 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  36.06 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  38.76 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  40 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  42.31 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  41.72 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  34.09 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  42.54 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  40.6 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  37.42 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  39.62 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  42.42 
 
 		 440 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  39.55 
 
 		 422 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  42.62 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  40.98 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  33.05 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  40.31 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  33.93 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  35.87 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  34.18 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  37.88 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  42.25 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  34.25 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  42.25 
 
 		 238 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  41.8 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  31.6 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  33.54 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  33.54 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  33.54 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  39.53 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  33.54 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  36 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0875  protein of unknown function DUF477  40 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000594367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  34.48 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  37.75 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  36.42 
 
 		 258 aa  99.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>