137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2026 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  100 
 
 
260 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  61.29 
 
 
250 aa  219  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  51.9 
 
 
256 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  50.46 
 
 
246 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  63.51 
 
 
259 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  52.58 
 
 
229 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  62.59 
 
 
246 aa  182  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  52.73 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  53.05 
 
 
288 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  51.11 
 
 
299 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  50.59 
 
 
285 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  55.1 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  55.35 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  47.74 
 
 
302 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  43.46 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  42.26 
 
 
288 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  42.22 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  47.22 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  45.45 
 
 
290 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  40.38 
 
 
264 aa  132  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  45 
 
 
315 aa  132  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  43.83 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  41.08 
 
 
256 aa  131  9e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  38.42 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  41.67 
 
 
315 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  45 
 
 
315 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  43.71 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  37.37 
 
 
294 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  41.67 
 
 
261 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  38.67 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  38.67 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  45.27 
 
 
166 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  43.09 
 
 
237 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  41.11 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  37.56 
 
 
250 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  39.31 
 
 
299 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  44.12 
 
 
341 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  34.5 
 
 
274 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  42.07 
 
 
343 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  43.38 
 
 
301 aa  121  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  40.85 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  36.61 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  42.5 
 
 
262 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  39.75 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  39.74 
 
 
277 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  34.93 
 
 
287 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  33.05 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  37.04 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  38.41 
 
 
284 aa  117  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  38.18 
 
 
293 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  38.18 
 
 
286 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  39.86 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  38.41 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  35.96 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  37.8 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  44.17 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  37.8 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  37.8 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  37.8 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  37.8 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1889  hypothetical protein  36.52 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  40.15 
 
 
440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  37.58 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  39.13 
 
 
292 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  37.8 
 
 
282 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  35.12 
 
 
287 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  36.16 
 
 
286 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  35.58 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  40.56 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  34.18 
 
 
266 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  34.12 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  41.73 
 
 
290 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  42.96 
 
 
253 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  43.41 
 
 
258 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  39.42 
 
 
453 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3453  hypothetical protein  37.43 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529474  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  40.58 
 
 
314 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  41.61 
 
 
251 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  40.62 
 
 
423 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  40.58 
 
 
265 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0875  protein of unknown function DUF477  34.41 
 
 
264 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000594367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  41.36 
 
 
269 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  41.43 
 
 
271 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  39.74 
 
 
238 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2520  protein of unknown function DUF477  40.44 
 
 
298 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  37.5 
 
 
281 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  36.76 
 
 
306 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  39.87 
 
 
238 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  37.5 
 
 
313 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  33.76 
 
 
310 aa  99.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  29.85 
 
 
297 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  31.41 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1459  hypothetical protein  39.71 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000468004  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  30.86 
 
 
309 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  33.54 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1401  protein of unknown function DUF477  36.3 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  36.84 
 
 
419 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04780  hypothetical protein  35 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746137  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  33.09 
 
 
295 aa  95.9  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  32.21 
 
 
305 aa  95.1  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>