139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3955 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  80 
 
 		 307 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  84.48 
 
 		 301 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  61.35 
 
 		 290 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  59.53 
 
 		 295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  60.08 
 
 		 288 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  54.66 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  50.84 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  50.89 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  49.59 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  49.8 
 
 		 286 aa  218  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  50 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  45.85 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  45.85 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  51.69 
 
 		 336 aa  205  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  53.92 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  53.3 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  53 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  53 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  53 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  53 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  53 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  53 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  48 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  45.67 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  48.67 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  57.83 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  48.64 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  46.54 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  44.54 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  49.5 
 
 		 281 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  49.75 
 
 		 305 aa  179  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2520  protein of unknown function DUF477  46.64 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  60.14 
 
 		 440 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  58.45 
 
 		 288 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  60.43 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  60.43 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  57.97 
 
 		 453 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  46.78 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  41.15 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  43.33 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  43.42 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  55.17 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  52.38 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0315  hypothetical protein  48.42 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.929741  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0310  protein of unknown function DUF477  48.42 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  40.55 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0380  hypothetical protein  43.1 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  45.18 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  45.27 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  42.5 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  51.32 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  50.66 
 
 		 261 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  52.94 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  49.35 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  47.85 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  50.36 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  47.55 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  40.76 
 
 		 285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  41.47 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  43.9 
 
 		 250 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  45.57 
 
 		 246 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  48.2 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  36.84 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  46.88 
 
 		 270 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  44.23 
 
 		 302 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  48.25 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  40.91 
 
 		 256 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  45.1 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  48.94 
 
 		 265 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  45.83 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  48.1 
 
 		 237 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  38.89 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  40.94 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  48.53 
 
 		 253 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  42.5 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  46.27 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  41.88 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  41.88 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  49.62 
 
 		 166 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  41.25 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  40.51 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  37.67 
 
 		 386 aa  122  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  48.44 
 
 		 423 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  32.56 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  46.88 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  40.51 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  36.32 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  42.25 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  38.96 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  41.3 
 
 		 229 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  36.77 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  41.03 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  41.18 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  37.89 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  43.2 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  34.86 
 
 		 396 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  42.86 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  41.86 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  41.73 
 
 		 266 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>