137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_06980 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  94.16 
 
 
343 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  53.37 
 
 
286 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  59.62 
 
 
292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  56.13 
 
 
277 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  57.32 
 
 
288 aa  180  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  55.48 
 
 
283 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  64.71 
 
 
440 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  63.24 
 
 
453 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  42.86 
 
 
302 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  59.29 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  59.03 
 
 
307 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  59.72 
 
 
287 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  53.61 
 
 
293 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  53.61 
 
 
286 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  58.27 
 
 
290 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  50.27 
 
 
295 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  39.09 
 
 
283 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  55.71 
 
 
282 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  55.71 
 
 
282 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  55.71 
 
 
282 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  55.71 
 
 
282 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  55.71 
 
 
282 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  55.71 
 
 
282 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  55.71 
 
 
282 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  53.05 
 
 
320 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  50.93 
 
 
419 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  56.83 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  52.63 
 
 
281 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  50.64 
 
 
422 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  55.24 
 
 
301 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  45.93 
 
 
287 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2520  protein of unknown function DUF477  57.86 
 
 
298 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  49.08 
 
 
310 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  46.78 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  45.81 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  44.19 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  46.1 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  43.79 
 
 
315 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  50.71 
 
 
295 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  51.77 
 
 
314 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  46.31 
 
 
315 aa  142  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  47.59 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  51.16 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  43.71 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  47.83 
 
 
309 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  50.34 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  52.31 
 
 
423 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  47.1 
 
 
290 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  46.58 
 
 
285 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  45.45 
 
 
256 aa  135  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  46.2 
 
 
270 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  48.89 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  48.23 
 
 
261 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  40.61 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  48.84 
 
 
294 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  43.48 
 
 
299 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  45.59 
 
 
250 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  46.21 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  47.41 
 
 
262 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  40 
 
 
242 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  40 
 
 
290 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  40 
 
 
290 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  45.64 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  45.64 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  40 
 
 
290 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  39.02 
 
 
246 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  41.36 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  44.37 
 
 
299 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  41.61 
 
 
290 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  40.74 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  48.06 
 
 
256 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  48.87 
 
 
253 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  44.76 
 
 
313 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  37.99 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  38.79 
 
 
290 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  44.12 
 
 
260 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  45.32 
 
 
166 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  47.37 
 
 
265 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  44.08 
 
 
277 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0315  hypothetical protein  50.36 
 
 
300 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.929741  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  42.65 
 
 
259 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  41.18 
 
 
229 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0310  protein of unknown function DUF477  50.36 
 
 
302 aa  122  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176101  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  41.18 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  40.13 
 
 
264 aa  119  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  41.35 
 
 
235 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  41.88 
 
 
237 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  43.41 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  35.71 
 
 
259 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1459  hypothetical protein  47.45 
 
 
254 aa  116  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000468004  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  42.86 
 
 
284 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  40.57 
 
 
290 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  43.23 
 
 
250 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  42.58 
 
 
305 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  45.11 
 
 
389 aa  113  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0380  hypothetical protein  45.32 
 
 
313 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  45.11 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3453  hypothetical protein  46.58 
 
 
299 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529474  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  43.84 
 
 
269 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>