137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0103 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  586  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  63.36 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  63.27 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  60 
 
 		 305 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  55.02 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0315  hypothetical protein  60 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.929741  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0310  protein of unknown function DUF477  60 
 
 		 302 aa  222  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176101  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  55.98 
 
 		 313 aa  222  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2520  protein of unknown function DUF477  54.02 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  52.19 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0380  hypothetical protein  54.75 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  51.11 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  47.35 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  47.83 
 
 		 288 aa  205  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  44.8 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  43.78 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  56.89 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  44.72 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  45.22 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  48 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  46.15 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  45.91 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  43.78 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  45.58 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  43.56 
 
 		 286 aa  171  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  45.49 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  47.51 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  48.28 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  48.28 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  42.92 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  40.87 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  40.98 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  43.78 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  43.28 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  43.28 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  43.28 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  43.28 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  43.28 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  43.28 
 
 		 282 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  49.66 
 
 		 419 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  44.78 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  40.52 
 
 		 422 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  39.91 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  51.45 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  43.2 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  42.86 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  49.28 
 
 		 440 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  43.55 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  43.1 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  39.13 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  40.2 
 
 		 279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  33.07 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  48.57 
 
 		 341 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  49.29 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  32.27 
 
 		 288 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  42.95 
 
 		 261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  45.39 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  35.23 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  35.23 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  42.55 
 
 		 261 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  36.67 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  34.05 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  43.26 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  42.65 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  35.78 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  40.13 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  37.72 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  42.65 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  38.41 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  36.81 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  37.57 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  40.71 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  37.57 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  30.52 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  41.55 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  38.1 
 
 		 386 aa  105  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  36.76 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  42.19 
 
 		 423 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  38.16 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  36.02 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  37.68 
 
 		 229 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  39.57 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  36.13 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  35.53 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  36.36 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  36.36 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  31.77 
 
 		 250 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  36.76 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  37.68 
 
 		 166 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  36.76 
 
 		 290 aa  95.5  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  38.76 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  38.76 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  38.76 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  38.89 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  38.76 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  36.29 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  35.9 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  36.88 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5849  protein of unknown function DUF477  37.14 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522543 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  37.78 
 
 		 238 aa  92.8  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>