142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4747 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3453  hypothetical protein  56.91 
 
 		 299 aa  175  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529474  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  59.06 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  53.06 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  56.29 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  56.29 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  55.86 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  55.48 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  46.41 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  45.18 
 
 		 294 aa  154  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  53.55 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  47.83 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  47.83 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  51.53 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  35.06 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  43.32 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  53.96 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  50 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  57.89 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  51.06 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  40.72 
 
 		 315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  39.71 
 
 		 256 aa  135  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  40.64 
 
 		 299 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  42.36 
 
 		 290 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  40.88 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  42.86 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  39.09 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  41.88 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  36.24 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  37.24 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  46.32 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  45.31 
 
 		 235 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  42.47 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  34.21 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  38.89 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  36.73 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  41.5 
 
 		 283 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  37.98 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  41.14 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  40.26 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  39.04 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  37.78 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  39.13 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  39.49 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  41.33 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  39.33 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  43.48 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0875  protein of unknown function DUF477  41.77 
 
 		 264 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000594367  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  43.7 
 
 		 250 aa  111  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  41.33 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  38.65 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  34.34 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  39.35 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  37.18 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  40.61 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  42.14 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3992  hypothetical protein  36.02 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  44.06 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  44.06 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 282 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 282 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 282 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 282 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  43.55 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  41.04 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  33.01 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  41.29 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  39.55 
 
 		 287 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4289  hypothetical protein  35.84 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  38.26 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  36.36 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  36.36 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  36.36 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  36.36 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  36.67 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  37.22 
 
 		 389 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  38.41 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  34.94 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  39.52 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  38.67 
 
 		 386 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  38.64 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  36.36 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  43.1 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  35.5 
 
 		 341 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  35.52 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  38.67 
 
 		 396 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  35.06 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  38.46 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  35.11 
 
 		 238 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  34.91 
 
 		 343 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  33 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  32.85 
 
 		 288 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3702  hypothetical protein  31.28 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83448  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  38.58 
 
 		 419 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  37.93 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  37.12 
 
 		 310 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  39.16 
 
 		 422 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>