137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1889 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1889  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  529  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04780  hypothetical protein  52.27 
 
 
267 aa  203  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  41.14 
 
 
260 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  39 
 
 
287 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  36.47 
 
 
256 aa  122  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  38 
 
 
288 aa  121  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  36.45 
 
 
290 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  41.57 
 
 
259 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  35.6 
 
 
229 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  36.26 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  34.84 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5849  protein of unknown function DUF477  37.76 
 
 
282 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.522543 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  36.21 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  34.81 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  35.84 
 
 
260 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  36.02 
 
 
302 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  43.61 
 
 
235 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  31.63 
 
 
294 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  35.67 
 
 
246 aa  105  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  36.43 
 
 
299 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  37.14 
 
 
271 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  34.71 
 
 
250 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  34.23 
 
 
267 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  36.42 
 
 
277 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  34.23 
 
 
266 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1401  protein of unknown function DUF477  38.41 
 
 
264 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3702  hypothetical protein  32.94 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83448  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  34.87 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  35.56 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  31.95 
 
 
250 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  36.31 
 
 
315 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  32.73 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  32.7 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  32.7 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  36.94 
 
 
256 aa  94  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  27.62 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  33.53 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  31.01 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  30.13 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  38.71 
 
 
281 aa  93.2  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  33.56 
 
 
290 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  33.12 
 
 
290 aa  92.4  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.570218 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  33.56 
 
 
290 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  33.56 
 
 
290 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  33.56 
 
 
290 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  31.94 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  35.44 
 
 
315 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  33.56 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  36.72 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  32.67 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  31.01 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  29.77 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  31.21 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  27.36 
 
 
292 aa  85.9  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  38.19 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  25.68 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  31.16 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  28.19 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  28.82 
 
 
295 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  30.38 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  32.69 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  29.63 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  30.26 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  29.65 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  29.25 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  26.92 
 
 
301 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  28.16 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  28.83 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  28.22 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  32.33 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  32.58 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  29.95 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  25.95 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  28.22 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  36.43 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  28.22 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  28.22 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  28.22 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  28.22 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  31.76 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  30.37 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  31.03 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  31.97 
 
 
287 aa  79  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  32.37 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  32.92 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0291  hypothetical protein  30.43 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0034  protein of unknown function DUF477  32.88 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  28.14 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  31.94 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  29.63 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  29.63 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  27.54 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  25.86 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0361  hypothetical protein  30.06 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.343727 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  32.74 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  29.37 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  30.37 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  28.89 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>