136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04780 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04780  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  520  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1889  hypothetical protein  52.25 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  38.07 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  36.84 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  43.33 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  37.28 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  38.15 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  36.78 
 
 		 250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  41.1 
 
 		 271 aa  108  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  38.73 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  38.65 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  43.18 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  38.65 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  38.36 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  42.14 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3702  hypothetical protein  36.47 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83448  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  41.86 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  34.1 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5849  protein of unknown function DUF477  37.8 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  35.91 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  38.76 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  35.21 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  31.1 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  32.52 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  39.86 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  32.86 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  35.8 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1401  protein of unknown function DUF477  39.6 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  38.28 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  34.66 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  36.6 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  36.18 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  34.75 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  35.62 
 
 		 253 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  35.16 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  28.33 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  32.93 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  35.62 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  37.5 
 
 		 262 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  30.81 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  34.01 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  32.12 
 
 		 290 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  35.8 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  38.89 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_002950  PG0361  hypothetical protein  32.65 
 
 		 435 aa  90.5  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.343727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  28.09 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  27.59 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  27.87 
 
 		 282 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  27.32 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  27.32 
 
 		 282 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  27.32 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  27.32 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  27.32 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  27.32 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  28.43 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  35.71 
 
 		 315 aa  86.3  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  30.14 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  26.28 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  32.17 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  34.78 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  34.38 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  28 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  27.67 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3453  hypothetical protein  31.74 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529474  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  27.67 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  28.4 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  42 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  38.1 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  30 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  32.54 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  34.13 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  27.64 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  29.33 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  34.55 
 
 		 396 aa  79  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24940  methanol dehydrogenase  30.77 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  26.67 
 
 		 306 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  31.71 
 
 		 166 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  29.69 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  29.34 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  30 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0034  protein of unknown function DUF477  25.78 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  29.31 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  29.34 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  27.85 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  28.22 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  25.52 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  27.68 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4289  hypothetical protein  22.7 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  28.91 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  28.91 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  28.03 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0875  protein of unknown function DUF477  30.73 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000594367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  27.54 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  26.87 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  26.87 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  26.87 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  26.87 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  26.77 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  30.11 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>