139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0410 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  759    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  92.13 
 
 		 389 aa  625  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  59.52 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  38.46 
 
 		 283 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  38.05 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  39.17 
 
 		 301 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  36.36 
 
 		 285 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  38.99 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  40.7 
 
 		 264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  35.37 
 
 		 309 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  36.7 
 
 		 292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  35.32 
 
 		 277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  37.44 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  38.99 
 
 		 286 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  39.36 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  39.06 
 
 		 295 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  39.29 
 
 		 313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  37.57 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  33.91 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  33.91 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  38.64 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  38.66 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  38.07 
 
 		 282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  36.04 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  38.2 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  35.51 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  38.07 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  38.07 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  38.07 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  38.07 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  38.07 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  36.52 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  37.76 
 
 		 267 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  44.72 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  37.7 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  37.76 
 
 		 266 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  45.11 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  37.97 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  45.11 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  45.67 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  44.53 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  33.51 
 
 		 285 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  38.1 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  35.83 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  42.28 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  43.7 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  34.05 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  45.9 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5849  protein of unknown function DUF477  39.02 
 
 		 282 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522543 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  42.06 
 
 		 288 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  32.02 
 
 		 287 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4854  protein of unknown function DUF477  36.27 
 
 		 314 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  33.49 
 
 		 290 aa  103  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  34.08 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  40.6 
 
 		 281 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  36.11 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  30.39 
 
 		 288 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  33.49 
 
 		 290 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  33.49 
 
 		 290 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  33.49 
 
 		 290 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  40 
 
 		 271 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  36.36 
 
 		 256 aa  100  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  32.49 
 
 		 305 aa  99.8  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  39.85 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  40.98 
 
 		 235 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  34.15 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  41.22 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  30.91 
 
 		 297 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  34.5 
 
 		 287 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  32.37 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0315  hypothetical protein  38.1 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.929741  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  32.43 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  32.54 
 
 		 290 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  32.58 
 
 		 250 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0310  protein of unknown function DUF477  38.1 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  37.18 
 
 		 265 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  34.81 
 
 		 274 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  33.5 
 
 		 287 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  34.43 
 
 		 288 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  39.87 
 
 		 251 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  37.18 
 
 		 253 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  34.5 
 
 		 279 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  39.1 
 
 		 260 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  35.97 
 
 		 262 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  38.52 
 
 		 294 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  39.37 
 
 		 259 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  32.69 
 
 		 258 aa  90.1  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  38.89 
 
 		 166 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  32.8 
 
 		 266 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  32.78 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  38.46 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  42.02 
 
 		 301 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  38.46 
 
 		 290 aa  88.6  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  29.17 
 
 		 284 aa  88.2  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  34.9 
 
 		 261 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  34.9 
 
 		 261 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3453  hypothetical protein  36.9 
 
 		 299 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529474  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  39.72 
 
 		 269 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  36.57 
 
 		 237 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>