127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1534 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1534  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 537 aa  1076    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6486  filamentation induced by cAMP protein Fic  57.71 
 
 		 514 aa  568  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.761112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1039  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.43 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0890  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.63 
 
 		 555 aa  432  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0367824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2096  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.93 
 
 		 479 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0597  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.23 
 
 		 512 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1647  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.89 
 
 		 502 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.887162  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0908  hypothetical protein  36.59 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.207571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0910  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.37 
 
 		 564 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1736  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.9 
 
 		 502 aa  299  9e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00739697  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2182  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.97 
 
 		 513 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108003  normal  0.0333314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0424  hypothetical protein  35.57 
 
 		 512 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00863334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4531  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.62 
 
 		 514 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139108 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7027  putative filamentation induced by cAMP protein Fic  34.86 
 
 		 537 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0353  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.17 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1561  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.38 
 
 		 536 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2478  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.04 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321663  normal  0.723541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2191  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.18 
 
 		 508 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0051  hypothetical protein  31.76 
 
 		 519 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6074  filamentation induced by cAMP protein Fic  34 
 
 		 544 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.95 
 
 		 498 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2025  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.65 
 
 		 507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.509627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2666  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.48 
 
 		 496 aa  181  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49750  filamentation induced by cAMP protein  30.33 
 
 		 509 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.54 
 
 		 511 aa  176  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2022  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.48 
 
 		 505 aa  170  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  37.07 
 
 		 429 aa  56.2  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  30.77 
 
 		 376 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  31.87 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.77 
 
 		 376 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.77 
 
 		 381 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.12 
 
 		 430 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.5 
 
 		 371 aa  53.9  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.95 
 
 		 374 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.95 
 
 		 374 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.95 
 
 		 374 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.11 
 
 		 427 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  38.3 
 
 		 383 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  37.14 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  31.67 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.08 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.25 
 
 		 365 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  39.64 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.46 
 
 		 247 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.86 
 
 		 412 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.08 
 
 		 371 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  36.46 
 
 		 373 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.66 
 
 		 412 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  31.4 
 
 		 408 aa  51.6  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  28.79 
 
 		 386 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  38.64 
 
 		 386 aa  51.2  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  38.46 
 
 		 376 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.15 
 
 		 370 aa  50.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.85 
 
 		 371 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.85 
 
 		 371 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  40.85 
 
 		 371 aa  50.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.78 
 
 		 393 aa  50.4  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 376 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.12 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.1 
 
 		 326 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.59 
 
 		 373 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.97 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.46 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.46 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.64 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  30.94 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  38.46 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.37 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.47 
 
 		 375 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.62 
 
 		 369 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  28.1 
 
 		 377 aa  48.5  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.46 
 
 		 368 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.03 
 
 		 367 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.68 
 
 		 333 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  37.18 
 
 		 369 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  34.83 
 
 		 367 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.4 
 
 		 385 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.1 
 
 		 447 aa  48.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.46 
 
 		 371 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.86 
 
 		 375 aa  47.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  38.03 
 
 		 374 aa  47.8  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0838  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.33 
 
 		 505 aa  47.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.32 
 
 		 373 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  34.12 
 
 		 502 aa  47.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.08 
 
 		 394 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  31.21 
 
 		 365 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.24 
 
 		 347 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  39.68 
 
 		 342 aa  47  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.89 
 
 		 367 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.35 
 
 		 508 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.59 
 
 		 368 aa  47  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.03 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.23 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.23 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.3 
 
 		 373 aa  47  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.74 
 
 		 247 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.05 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.33 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  43.66 
 
 		 364 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.29 
 
 		 508 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>