133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1561 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7027  putative filamentation induced by cAMP protein Fic  66.92 
 
 		 537 aa  749    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1561  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 536 aa  1095    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2478  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.14 
 
 		 526 aa  580  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321663  normal  0.723541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0051  hypothetical protein  52.61 
 
 		 519 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6074  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.1 
 
 		 544 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0424  hypothetical protein  45.42 
 
 		 512 aa  445  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00863334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2191  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.42 
 
 		 508 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2182  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.08 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108003  normal  0.0333314 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4531  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.97 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0597  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.1 
 
 		 512 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1647  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.97 
 
 		 502 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.887162  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0908  hypothetical protein  32.66 
 
 		 503 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.207571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1736  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.98 
 
 		 502 aa  250  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00739697  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1534  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.38 
 
 		 537 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0910  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.44 
 
 		 564 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1039  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.08 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6486  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.96 
 
 		 514 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.761112 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0890  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.78 
 
 		 555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0367824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2096  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.49 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.22 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0353  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.94 
 
 		 495 aa  163  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49750  filamentation induced by cAMP protein  25.19 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2022  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.73 
 
 		 505 aa  157  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2666  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.63 
 
 		 496 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2025  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.06 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.509627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.13 
 
 		 498 aa  139  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.04 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  43.75 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.33 
 
 		 392 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.34 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.08 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.67 
 
 		 387 aa  60.1  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.48 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  29.92 
 
 		 348 aa  57  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  29.92 
 
 		 348 aa  57  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.19 
 
 		 387 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  32.35 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 376 aa  55.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.95 
 
 		 508 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.57 
 
 		 374 aa  54.3  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  27 
 
 		 333 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.76 
 
 		 381 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.94 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.57 
 
 		 309 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.63 
 
 		 509 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0838  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.45 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.59 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.38 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.37 
 
 		 508 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  31.07 
 
 		 376 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  31.07 
 
 		 389 aa  52  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.07 
 
 		 376 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  32.61 
 
 		 377 aa  51.6  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.76 
 
 		 376 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.95 
 
 		 370 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.78 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.12 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.96 
 
 		 389 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.03 
 
 		 333 aa  51.2  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.28 
 
 		 394 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.42 
 
 		 247 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.65 
 
 		 531 aa  50.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0277  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.29 
 
 		 508 aa  50.4  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000636262  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  32.63 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.81 
 
 		 374 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.27 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  31.31 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.3 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.21 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  38.55 
 
 		 386 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  31 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.63 
 
 		 313 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.94 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  35.62 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  30.19 
 
 		 376 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  32 
 
 		 373 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  32.11 
 
 		 367 aa  47.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.51 
 
 		 380 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  37.5 
 
 		 386 aa  47.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 369 aa  47.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  35 
 
 		 408 aa  47.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.88 
 
 		 393 aa  47.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.22 
 
 		 256 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 375 aa  47.4  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.69 
 
 		 363 aa  47.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  35.29 
 
 		 365 aa  47  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  32 
 
 		 379 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.73 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  24.86 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.67 
 
 		 391 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.14 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 386 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  36.11 
 
 		 388 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.88 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  30.48 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  32.88 
 
 		 358 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1058  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.92 
 
 		 369 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  31.25 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.51 
 
 		 247 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>