141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0424 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0424  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1050    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00863334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6074  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.51 
 
 		 544 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2182  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.31 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108003  normal  0.0333314 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4531  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.73 
 
 		 514 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2191  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.12 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1561  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.42 
 
 		 536 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7027  putative filamentation induced by cAMP protein Fic  44.55 
 
 		 537 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2478  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.55 
 
 		 526 aa  428  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321663  normal  0.723541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0051  hypothetical protein  43.61 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1534  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.57 
 
 		 537 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0597  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.37 
 
 		 512 aa  246  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1647  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.23 
 
 		 502 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.887162  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0908  hypothetical protein  33.13 
 
 		 503 aa  240  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.207571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1736  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.16 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00739697  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0910  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.51 
 
 		 564 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6486  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.01 
 
 		 514 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.761112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1039  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.35 
 
 		 516 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2025  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.47 
 
 		 507 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.509627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0353  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.87 
 
 		 495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0890  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.93 
 
 		 555 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0367824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2666  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.57 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2096  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.8 
 
 		 479 aa  177  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49750  filamentation induced by cAMP protein  26.79 
 
 		 509 aa  171  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.73 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2022  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.12 
 
 		 505 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.28 
 
 		 511 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.11 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  38.04 
 
 		 502 aa  60.1  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  35 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.71 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  36.89 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.11 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.77 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.59 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.66 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.37 
 
 		 247 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.48 
 
 		 247 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  37.84 
 
 		 373 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.3 
 
 		 509 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  36.94 
 
 		 373 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  29.13 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.58 
 
 		 412 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  38 
 
 		 386 aa  53.5  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.12 
 
 		 379 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.99 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0044  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.37 
 
 		 419 aa  52.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.203132 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  36.99 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  30.36 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  34.78 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.1 
 
 		 387 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.43 
 
 		 379 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.94 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.27 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.04 
 
 		 374 aa  52  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.13 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  35.04 
 
 		 384 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  33.64 
 
 		 368 aa  52  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.84 
 
 		 508 aa  51.2  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  28.18 
 
 		 376 aa  50.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.13 
 
 		 412 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.21 
 
 		 380 aa  50.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.12 
 
 		 373 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 393 aa  50.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.35 
 
 		 427 aa  50.4  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  36.9 
 
 		 252 aa  50.1  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.61 
 
 		 313 aa  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.26 
 
 		 358 aa  50.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0838  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.31 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  32.58 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.02 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.43 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.85 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.85 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  33.67 
 
 		 348 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  33.67 
 
 		 348 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  35.62 
 
 		 377 aa  48.5  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.13 
 
 		 368 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.79 
 
 		 394 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.8 
 
 		 309 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.08 
 
 		 385 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.73 
 
 		 381 aa  47.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0277  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 508 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000636262  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.69 
 
 		 376 aa  47.4  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  34.45 
 
 		 364 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 381 aa  47.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  34.72 
 
 		 388 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.43 
 
 		 391 aa  47  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  35.19 
 
 		 377 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  37.23 
 
 		 342 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.64 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.31 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 508 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.26 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 343 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.6 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.69 
 
 		 358 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.13 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.14 
 
 		 531 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>