235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0315 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0315  NifU-like protein  100 
 
 		 335 aa  692    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000902631  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5092  NifQ family protein  38.1 
 
 		 236 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0978  NifQ  35.98 
 
 		 236 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789318  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2281  NifQ  35.07 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1082  NifQ  34.92 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4454  NifQ  34.94 
 
 		 235 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3988  NifQ family protein  31.76 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5878  putative nitrogen fixation protein nifQ  36.09 
 
 		 245 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3543  NifQ family protein  35.26 
 
 		 217 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  0.0106924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1355  NifQ family protein  40.4 
 
 		 224 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1209  NifQ family protein  34.73 
 
 		 204 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0239  nitrogen fixation protein nifQ, putative  36.05 
 
 		 197 aa  93.6  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.305155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1448  NifQ  34.5 
 
 		 190 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2319  NifQ family protein  38.16 
 
 		 200 aa  92.8  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00231718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1254  NifQ family protein  48.19 
 
 		 179 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1511  nitrogen fixation protein NifQ  28.99 
 
 		 217 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.203705  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3623  NifQ family protein  30.59 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2185  NifQ family protein  35.62 
 
 		 179 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.149657 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1229  NifQ family protein  28.99 
 
 		 217 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411993  hitchhiker  0.000327606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1476  putative nitrogen fixation-related protein(NifQ)  32.69 
 
 		 192 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0533  putative nitrogen fixation protein nifQ  35.62 
 
 		 179 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.057616  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0482  NifQ family protein  42.17 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7734  NifQ family protein  35.33 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1561  NifQ family protein  31.36 
 
 		 205 aa  82  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0097  NifQ family protein  31.25 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51040  Nitrogen fixation cofactor assembly protein  32.68 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0404512  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.75 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0280  NifQ family protein  38.1 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  30.83 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0514  NifQ family protein  40.74 
 
 		 170 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.95 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4126  putative nitrogen fixation protein NifQ  29.35 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.850177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.33 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.08 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  31.71 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.71 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.88 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.71 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.88 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  27.97 
 
 		 123 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  29.41 
 
 		 144 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.62 
 
 		 131 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.03 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  28.57 
 
 		 125 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.41 
 
 		 142 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  29.41 
 
 		 149 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.66 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  28.46 
 
 		 137 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  31.62 
 
 		 129 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.51 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  29.27 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  27.97 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  29.29 
 
 		 143 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  34 
 
 		 129 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  28.81 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  27.27 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  28.57 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0869  nitrogen-fixing NifU domain protein  36 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.16 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.78 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  26.45 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  33.33 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  30 
 
 		 122 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.83 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0951  NifU domain-containing protein  25 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.71 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  23.26 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  29.91 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.87 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.27 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.45 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.03 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  30.58 
 
 		 173 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  25 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.66 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  31.25 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  25.42 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  25.98 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  27.97 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6662  NifQ family protein  31.36 
 
 		 195 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0612725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  29.06 
 
 		 211 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  39.29 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7727  hypothetical protein  30.56 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  30.51 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  25.93 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5817  hypothetical protein  40.24 
 
 		 195 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0755025  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6182  NifQ family protein  40.24 
 
 		 195 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.68 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  31.65 
 
 		 131 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  26.89 
 
 		 137 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.13 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0021  NifU-like protein  27.97 
 
 		 143 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.13876e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  25.93 
 
 		 280 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.13 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  29 
 
 		 163 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1928  NifU domain-containing protein  31.58 
 
 		 156 aa  53.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46543  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.45 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  36.84 
 
 		 143 aa  53.1  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  36.84 
 
 		 143 aa  53.1  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1354  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  36.45 
 
 		 488 aa  52.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>