95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0132 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0132  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 554 aa  1127    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0071  radical SAM domain-containing protein  49.51 
 
 		 551 aa  491  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2386  amino acid adenylation domain protein  22.71 
 
 		 1893 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1046  Radical SAM domain protein  22.61 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  22.09 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  21.08 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  21.95 
 
 		 472 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  24.88 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.94 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0780  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 647 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.85 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  24.24 
 
 		 864 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.03 
 
 		 554 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 528 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 494 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.12 
 
 		 647 aa  56.2  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1924  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.31 
 
 		 612 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  22.17 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  21.63 
 
 		 473 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.62 
 
 		 546 aa  55.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.908643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  24.75 
 
 		 534 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0281  magnesium-protoporphyrin IX monomethylester oxidative cyclase, 66 kDa subunit(bchE)  24.31 
 
 		 612 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 426 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 		 501 aa  54.3  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 484 aa  54.7  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1180  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.33 
 
 		 647 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 494 aa  54.3  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1460  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.33 
 
 		 651 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0027  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.33 
 
 		 651 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0033  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.33 
 
 		 647 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  23.85 
 
 		 563 aa  53.9  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 533 aa  53.9  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  23.33 
 
 		 647 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  21.56 
 
 		 461 aa  53.5  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 625 aa  53.9  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  21.07 
 
 		 520 aa  53.5  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 		 487 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 459 aa  53.5  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.76 
 
 		 558 aa  53.5  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.03 
 
 		 651 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1014  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.31 
 
 		 600 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 		 575 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  23.86 
 
 		 474 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2209  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.41 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  21.3 
 
 		 529 aa  51.6  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.51 
 
 		 546 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2387  cobalamin B12-binding domain protein  23.23 
 
 		 545 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 564 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.65 
 
 		 546 aa  50.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.52 
 
 		 441 aa  50.8  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3812  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.64 
 
 		 569 aa  50.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.14 
 
 		 546 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  21.85 
 
 		 484 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  20.7 
 
 		 470 aa  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  31.03 
 
 		 554 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2158  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.66 
 
 		 546 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  21.05 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1435  radical SAM domain-containing protein  21.9 
 
 		 631 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0826343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0229  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.66 
 
 		 547 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0316  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.16 
 
 		 567 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  21.89 
 
 		 552 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  20.05 
 
 		 548 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  26.14 
 
 		 590 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0942  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.28 
 
 		 528 aa  47  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4064  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.65 
 
 		 508 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 		 540 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  22.18 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 562 aa  47  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 551 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 593 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4778  response regulator receiver protein  24.34 
 
 		 675 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0104454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.79 
 
 		 860 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  21.12 
 
 		 557 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.49 
 
 		 565 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1584  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  21.24 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 		 441 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2281  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.63 
 
 		 520 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2894  radical SAM family protein  20.75 
 
 		 613 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  21.67 
 
 		 468 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0197  radical SAM family protein  22.96 
 
 		 656 aa  45.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  24.24 
 
 		 589 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  22.08 
 
 		 564 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0614  radical SAM domain-containing protein  21.85 
 
 		 570 aa  44.3  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2019  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 525 aa  44.3  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0788272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.49 
 
 		 580 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3548  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.83 
 
 		 535 aa  43.9  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0375  radical SAM domain-containing protein  22.91 
 
 		 438 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0386229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 589 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>