More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4776 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4776  type III effector HopI1  100 
 
 		 488 aa  966    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4326  type III effector HopI1  67.74 
 
 		 336 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5251  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.95 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204163  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3418  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02238  DnaJ domain protein Psi, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07340)  56.92 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542195  normal  0.0811515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  53.03 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03160  chaperone regulator, putative  52.05 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3858  heat shock protein DnaJ domain protein  48 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  53.62 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  50.72 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36016  predicted protein  43.24 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.941412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0830  heat shock protein DnaJ-like  51.52 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  53.03 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  48.53 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  51.43 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0006  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  52.24 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  48.48 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0039  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4346  heat shock protein DnaJ, N-terminal  50.75 
 
 		 192 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5050  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05510  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  48 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.731884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  47.22 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4935  heat shock protein DnaJ domain protein  47.83 
 
 		 198 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.124962 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04192  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05900)  50 
 
 		 634 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107548  normal  0.45593 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03375  DnaJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01230)  59.18 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.698217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  45.45 
 
 		 304 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  46.97 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  44.87 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  49.25 
 
 		 381 aa  62  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1670  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal  0.0271561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1225  chaperone protein DnaJ  49.25 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.0136736 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  53.97 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30687  predicted protein  44.33 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.755284 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  50 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1968  chaperone protein DnaJ  49.25 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00646622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00892  DnaJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15460)  44.29 
 
 		 837 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.679022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  46.67 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5705  heat shock protein DnaJ domain protein  49.23 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635582  normal  0.873603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4767  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.58 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272795  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  49.25 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  51.47 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85654  yeast dnaJ homolog (nuclear envelope protein) heat shock protein  53.85 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.351399  normal  0.0803186 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0493  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0562  chaperone protein DnaJ  47.89 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.818243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  47.3 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  47.37 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2290  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256335 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2664  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  47.89 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  49.25 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  50.75 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  49.25 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1396  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.427983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0465  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  51.39 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0511  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.100964  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1276  chaperone protein DnaJ  46.03 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  47.56 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2910  hypothetical protein  44.78 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  50 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1015  putative DnaJ-like protein  47.69 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232085  normal  0.105814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1209  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.44 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  47.3 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  49.25 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  48.44 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3589  heat shock protein DnaJ domain protein  46.97 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0561803  normal  0.0551979 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  46.03 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  46.97 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>