More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5251 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5251  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204163  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3418  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  98.48 
 
 
197 aa  400  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1209  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.43 
 
 
215 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3858  heat shock protein DnaJ domain protein  50.24 
 
 
209 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254816  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4935  heat shock protein DnaJ domain protein  50.24 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.124962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5705  heat shock protein DnaJ domain protein  58.67 
 
 
225 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635582  normal  0.873603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4346  heat shock protein DnaJ, N-terminal  43.9 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1015  putative DnaJ-like protein  57.33 
 
 
235 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232085  normal  0.105814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  63.64 
 
 
385 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  62.9 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  60.94 
 
 
381 aa  78.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  62.9 
 
 
383 aa  78.6  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  64.52 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02238  DnaJ domain protein Psi, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07340)  48.65 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542195  normal  0.0811515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  55.22 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1225  chaperone protein DnaJ  60.94 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.0136736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  59.68 
 
 
379 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  59.68 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03375  DnaJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01230)  57.58 
 
 
466 aa  75.9  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.698217  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4776  type III effector HopI1  48.61 
 
 
488 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
379 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1968  chaperone protein DnaJ  60.32 
 
 
379 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00646622  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
396 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  52.78 
 
 
375 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
388 aa  75.1  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1601  chaperone protein DnaJ  58.73 
 
 
376 aa  75.1  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.095683  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  58.73 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  61.29 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  59.68 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  52.78 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0511  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.100964  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01186  chaperone protein DnaJ  59.68 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  55.56 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2053  chaperone protein DnaJ  58.73 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.519265  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  58.06 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  59.38 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57157  predicted protein  56.92 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.293411  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  58.06 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  52.11 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.47 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  50.79 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  53.85 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.97 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1768  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 
380 aa  72.4  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  61.29 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1299  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
371 aa  72.4  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1483  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 
373 aa  72.4  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.387506  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  56.45 
 
 
294 aa  72  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  56.06 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  57.81 
 
 
376 aa  72  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  52.94 
 
 
372 aa  72  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
375 aa  71.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  61.29 
 
 
287 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
378 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  53.23 
 
 
331 aa  71.6  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  53.03 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  54.84 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  46.75 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  58.06 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  58.06 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  54.84 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1422  chaperone DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000419249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  54.41 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10330  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0686048  unclonable  0.00000000184085 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85654  yeast dnaJ homolog (nuclear envelope protein) heat shock protein  50.7 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.351399  normal  0.0803186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2702  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3470  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3459  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3522  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  0.296321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>