More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3418 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3418  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5251  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  98.48 
 
 
219 aa  400  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204163  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1209  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.61 
 
 
215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3858  heat shock protein DnaJ domain protein  49.51 
 
 
209 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254816  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4935  heat shock protein DnaJ domain protein  49.51 
 
 
198 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.124962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5705  heat shock protein DnaJ domain protein  57.82 
 
 
225 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635582  normal  0.873603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4346  heat shock protein DnaJ, N-terminal  43.63 
 
 
192 aa  144  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1015  putative DnaJ-like protein  56.76 
 
 
235 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232085  normal  0.105814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  66.13 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  62.9 
 
 
316 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  64.52 
 
 
386 aa  77  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  61.29 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  59.38 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02238  DnaJ domain protein Psi, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07340)  48.61 
 
 
377 aa  75.1  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542195  normal  0.0811515 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
361 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
379 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
380 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  40.17 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1225  chaperone protein DnaJ  59.38 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.0136736 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03375  DnaJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01230)  58.73 
 
 
466 aa  73.2  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.698217  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  55.56 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4776  type III effector HopI1  50 
 
 
488 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  52.38 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  58.73 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1601  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.095683  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1968  chaperone protein DnaJ  58.73 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00646622  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
396 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1299  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
371 aa  72.4  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57157  predicted protein  58.06 
 
 
414 aa  72.4  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.293411  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0511  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 
378 aa  72.4  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.100964  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  59.68 
 
 
372 aa  72  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  52.11 
 
 
384 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.97 
 
 
291 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01186  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
376 aa  71.2  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12513  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2053  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 
378 aa  71.2  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.519265  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  56.45 
 
 
302 aa  71.2  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 
386 aa  71.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  56.45 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  58.06 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  52.94 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  57.81 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  56.45 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  52.94 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  54.84 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  54.84 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.97 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  59.68 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  58.06 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  54.84 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1768  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1483  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.387506  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  59.68 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2572  chaperone protein DnaJ  56.25 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  51.61 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  53.23 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  53.23 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
376 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
377 aa  68.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  58.06 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 
381 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  30.11 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4231  chaperone DnaJ domain protein  53.73 
 
 
349 aa  68.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  57.81 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  56.45 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
376 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
376 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
376 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
385 aa  68.9  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
378 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>