More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4326 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4326  type III effector HopI1  100 
 
 		 336 aa  689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4776  type III effector HopI1  72.91 
 
 		 488 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5050  chaperone protein DnaJ  54.55 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5251  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204163  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  50 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3418  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.14 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  57.58 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02238  DnaJ domain protein Psi, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07340)  53.03 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542195  normal  0.0811515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  49.25 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  53.73 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  52.24 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  57.58 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  53.03 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1670  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal  0.0271561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  50 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  52.94 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  48.72 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 383 aa  67  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  47.89 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  51.52 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  51.52 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  50.75 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85654  yeast dnaJ homolog (nuclear envelope protein) heat shock protein  54.55 
 
 		 404 aa  65.9  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.351399  normal  0.0803186 
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  53.03 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08256  chaperone protein dnaJ  50.79 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.482747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.97 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2664  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04440  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  50 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253974 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  48.48 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0039  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  51.47 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.47 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1904  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2290  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256335 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00892  DnaJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15460)  48.48 
 
 		 837 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.679022 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  50 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0040  chaperone protein DnaJ  54.72 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  44.44 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  46.97 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.48 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  48.44 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  48.44 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1208  heat shock protein DnaJ domain protein  47.06 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03160  chaperone regulator, putative  51.56 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  48.44 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  46.27 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.44 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  48.44 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  48.44 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0830  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  48.44 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  50.75 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  48.44 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  48.44 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  48.44 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  53.12 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01120  chaperone regulator, putative  50 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4767  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.58 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272795  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0493  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  47.06 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.78 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  48.44 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3858  heat shock protein DnaJ domain protein  41.77 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  53.12 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.03 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2053  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.519265  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15747  predicted protein  43.48 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  46.88 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  49.28 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  46.15 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.21 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  53.03 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02731  protein mitochondrial targeting protein (Mas1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05040)  50.77 
 
 		 412 aa  62.4  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  48.44 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  51.72 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>