187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2643 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2643  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 255 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  84.19 
 
 		 535 aa  447  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2100  chemotaxis sensory transducer  38.82 
 
 		 537 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.517374  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2240  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 		 537 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.73 
 
 		 602 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180362  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00039  chemotaxis protein  33.05 
 
 		 775 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0697  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.19 
 
 		 610 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0640  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.1 
 
 		 604 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122515  normal  0.297773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 528 aa  82.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 		 542 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.57 
 
 		 570 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  29.62 
 
 		 546 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 		 535 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.11 
 
 		 601 aa  62.4  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.229221  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  34 
 
 		 541 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.75 
 
 		 552 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 541 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37 
 
 		 541 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 541 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1881  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.71 
 
 		 592 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.81 
 
 		 660 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 		 541 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.9 
 
 		 542 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.128174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.01 
 
 		 585 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 644 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.858801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.91 
 
 		 571 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 541 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 		 634 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 661 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  36.59 
 
 		 660 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  36.54 
 
 		 600 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 		 427 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.8922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 		 660 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 541 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  32.81 
 
 		 660 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 542 aa  48.9  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3236  methyl-accepting chemotaxis protein  27.72 
 
 		 544 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.54 
 
 		 513 aa  48.9  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  43.08 
 
 		 660 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  41.54 
 
 		 660 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  29.69 
 
 		 660 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  29.69 
 
 		 660 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  29.69 
 
 		 660 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44 
 
 		 541 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 		 516 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  29.69 
 
 		 660 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.18 
 
 		 513 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  31.25 
 
 		 660 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  36.07 
 
 		 658 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3671  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46 
 
 		 509 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.353813  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0822  methyl-accepting chemotaxis protein  32.47 
 
 		 500 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.417583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  29.69 
 
 		 660 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  28.81 
 
 		 551 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.81 
 
 		 551 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  28.81 
 
 		 551 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  29.69 
 
 		 660 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  33.87 
 
 		 658 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  33.87 
 
 		 658 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  28.81 
 
 		 554 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  28.81 
 
 		 551 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.81 
 
 		 554 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2013  methyl-accepting chemotaxis protein  44 
 
 		 634 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  33.87 
 
 		 658 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  28.81 
 
 		 554 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 587 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5361  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 		 508 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0719  methyl-accepting chemotaxis protein  44 
 
 		 616 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0627  methyl-accepting chemotaxis protein  42.31 
 
 		 616 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202062  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  31.96 
 
 		 557 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  28.81 
 
 		 554 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.7 
 
 		 556 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 		 650 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 		 660 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  33.87 
 
 		 658 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 		 650 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  29.69 
 
 		 660 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  33.87 
 
 		 658 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 		 650 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.88 
 
 		 598 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.84 
 
 		 569 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  33.87 
 
 		 658 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.84 
 
 		 572 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138456  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46 
 
 		 608 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.32 
 
 		 578 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.14 
 
 		 660 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 		 562 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.248385  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 471 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 541 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 561 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  33.77 
 
 		 553 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00047  chemotaxis protein  34.21 
 
 		 733 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.3 
 
 		 554 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37293  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.32 
 
 		 515 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00046  chemotaxis protein  37.84 
 
 		 753 aa  46.2  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 541 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.95 
 
 		 559 aa  45.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 662 aa  45.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 549 aa  46.2  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.164628 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 		 538 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.307637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  24.27 
 
 		 508 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>