89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4475 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4475  succinylglutamate desuccinylase  100 
 
 		 335 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3980  succinylglutamate desuccinylase  97.61 
 
 		 335 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1440  succinylglutamate desuccinylase  98.51 
 
 		 335 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3764  succinylglutamate desuccinylase  93.71 
 
 		 335 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168218  normal  0.0907041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4279  succinylglutamate desuccinylase  76.79 
 
 		 336 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2905  succinylglutamate desuccinylase  75.3 
 
 		 337 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1838  succinylglutamate desuccinylase  72.24 
 
 		 335 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3559  succinylglutamate desuccinylase  71.94 
 
 		 335 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52630  succinylglutamate desuccinylase  72.34 
 
 		 332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4614  succinylglutamate desuccinylase  72.04 
 
 		 332 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257138  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2119  succinylglutamate desuccinylase  42.99 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2338  succinylglutamate desuccinylase  41.44 
 
 		 344 aa  238  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2132  succinylglutamate desuccinylase  41.37 
 
 		 344 aa  238  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000127118 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2722  succinylglutamate desuccinylase  43.16 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2780  succinylglutamate desuccinylase  43.16 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.578972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2841  succinylglutamate desuccinylase  43.16 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1731  succinylglutamate desuccinylase  43.16 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0596  succinylglutamate desuccinylase  43.16 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2871  succinylglutamate desuccinylase  43.16 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2029  succinylglutamate desuccinylase  40.77 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299129  hitchhiker  0.000166583 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1708  succinylglutamate desuccinylase  41.62 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.0550422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1946  succinylglutamate desuccinylase  42.77 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1884  succinylglutamate desuccinylase  42.14 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.823937  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2223  succinylglutamate desuccinylase  42.14 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4509  succinylglutamate desuccinylase  42.14 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2236  succinylglutamate desuccinylase  42.14 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00424439  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2148  succinylglutamate desuccinylase  42.14 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000502717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2198  succinylglutamate desuccinylase  42.14 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2277  succinylglutamate desuccinylase  43.15 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2330  succinylglutamate desuccinylase  42.96 
 
 		 347 aa  228  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127772 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1121  succinylglutamate desuccinylase  39.45 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0488  succinylglutamate desuccinylase  43.14 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2420  succinylglutamate desuccinylase  43.89 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1782  succinylglutamate desuccinylase  42.43 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2247  succinylglutamate desuccinylase  41.38 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1563  succinylglutamate desuccinylase  40.3 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02550  succinylglutamate desuccinylase  37.65 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.99047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1934  succinylglutamate desuccinylase  39.12 
 
 		 342 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00118272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1780  succinylglutamate desuccinylase  41.64 
 
 		 349 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1924  succinylglutamate desuccinylase  41.11 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.693854  hitchhiker  0.00111051 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1185  succinylglutamate desuccinylase  40.43 
 
 		 342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0562239  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0706  succinylglutamate desuccinylase  40.43 
 
 		 342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2840  succinylglutamate desuccinylase  43.96 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4296  succinylglutamate desuccinylase  40.18 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1866  succinylglutamate desuccinylase  40.37 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.934682  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1066  succinylglutamate desuccinylase  40.29 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1402  succinylglutamate desuccinylase  40.67 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1434  succinylglutamate desuccinylase  40.67 
 
 		 322 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1700  succinylglutamate desuccinylase  38.89 
 
 		 321 aa  212  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1419  succinylglutamate desuccinylase  40.37 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1785  succinylglutamate desuccinylase  39.1 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0703665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1066  succinylglutamate desuccinylase  39.89 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.444137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1162  succinylglutamate desuccinylase  40.73 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.412137  normal  0.073065 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2462  succinylglutamate desuccinylase  38.92 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1888  succinylglutamate desuccinylase  38.92 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0217529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1827  succinylglutamate desuccinylase  38.92 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1898  succinylglutamate desuccinylase  38.92 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.22228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1990  succinylglutamate desuccinylase  38.92 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.920225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01701  hypothetical protein  38.92 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01713  succinylglutamate desuccinylase  38.92 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1447  succinylglutamate desuccinylase  38.92 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50451 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1966  succinylglutamate desuccinylase  38.92 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2039  succinylglutamate desuccinylase  39.76 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2195  succinylglutamate desuccinylase  36.66 
 
 		 350 aa  205  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2918  succinylglutamate desuccinylase  39.09 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.354505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2780  succinylglutamate desuccinylase  39.63 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0633  succinylglutamate desuccinylase  33.82 
 
 		 396 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2516  succinylglutamate desuccinylase  36.42 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2117  succinylglutamate desuccinylase  36.42 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.728086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2225  succinylglutamate desuccinylase  36.42 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3311  succinylglutamate desuccinylase  37.96 
 
 		 350 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1730  succinylglutamate desuccinylase  34 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0863  succinylglutamate desuccinylase  34.59 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003688  succinylglutamate desuccinylase  32.06 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02131  succinylglutamate desuccinylase  31.65 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6046  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.24 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5816  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.24 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0224  aspartoacylase  34.21 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02431  aspartoacylase  33.03 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.378345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02421  aspartoacylase  30.97 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02521  aspartoacylase  32.38 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0691  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.33 
 
 		 302 aa  46.2  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04021  aspartoacylase  30.63 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3357  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.94 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00503474  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1591  aspartoacylase  26.52 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22830  predicted deacylase  32.2 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3769  Aspartoacylase  29.89 
 
 		 123 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.456471 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2696  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.1 
 
 		 272 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000509431  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2226  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.33 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>