87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0488 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0488  succinylglutamate desuccinylase  100 
 
 		 340 aa  684    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2840  succinylglutamate desuccinylase  65.12 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053422 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2516  succinylglutamate desuccinylase  58.79 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2117  succinylglutamate desuccinylase  58.79 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.728086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2225  succinylglutamate desuccinylase  58.18 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1447  succinylglutamate desuccinylase  52.13 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1888  succinylglutamate desuccinylase  52.13 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0217529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1966  succinylglutamate desuccinylase  52.45 
 
 		 322 aa  324  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1827  succinylglutamate desuccinylase  52.13 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01713  succinylglutamate desuccinylase  52.13 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1990  succinylglutamate desuccinylase  52.13 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.920225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01701  hypothetical protein  52.13 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1898  succinylglutamate desuccinylase  52.13 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.22228  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2462  succinylglutamate desuccinylase  51.83 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1402  succinylglutamate desuccinylase  53.23 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1866  succinylglutamate desuccinylase  52.92 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.934682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1434  succinylglutamate desuccinylase  53.23 
 
 		 322 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1419  succinylglutamate desuccinylase  52.62 
 
 		 322 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2039  succinylglutamate desuccinylase  52.31 
 
 		 322 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1700  succinylglutamate desuccinylase  49.54 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1731  succinylglutamate desuccinylase  49.7 
 
 		 349 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0596  succinylglutamate desuccinylase  49.7 
 
 		 349 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2871  succinylglutamate desuccinylase  49.7 
 
 		 349 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2780  succinylglutamate desuccinylase  49.7 
 
 		 349 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.578972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2722  succinylglutamate desuccinylase  49.7 
 
 		 349 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2841  succinylglutamate desuccinylase  49.7 
 
 		 349 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2119  succinylglutamate desuccinylase  47.2 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2420  succinylglutamate desuccinylase  50.83 
 
 		 311 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1780  succinylglutamate desuccinylase  48.78 
 
 		 349 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4296  succinylglutamate desuccinylase  46.53 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0706  succinylglutamate desuccinylase  44.84 
 
 		 342 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1185  succinylglutamate desuccinylase  44.84 
 
 		 342 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0562239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1066  succinylglutamate desuccinylase  43.65 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.444137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1563  succinylglutamate desuccinylase  45.27 
 
 		 342 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1066  succinylglutamate desuccinylase  43.26 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1162  succinylglutamate desuccinylase  44.84 
 
 		 342 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.412137  normal  0.073065 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2918  succinylglutamate desuccinylase  44.84 
 
 		 342 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.354505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1782  succinylglutamate desuccinylase  42.65 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1440  succinylglutamate desuccinylase  43.32 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3764  succinylglutamate desuccinylase  43.14 
 
 		 335 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168218  normal  0.0907041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4475  succinylglutamate desuccinylase  43.14 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3980  succinylglutamate desuccinylase  43.14 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2905  succinylglutamate desuccinylase  43.85 
 
 		 337 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1838  succinylglutamate desuccinylase  42.58 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4279  succinylglutamate desuccinylase  41.27 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3559  succinylglutamate desuccinylase  42.77 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4614  succinylglutamate desuccinylase  43 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52630  succinylglutamate desuccinylase  43.04 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2247  succinylglutamate desuccinylase  39.86 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195913  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1924  succinylglutamate desuccinylase  40.28 
 
 		 355 aa  205  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.693854  hitchhiker  0.00111051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0633  succinylglutamate desuccinylase  34.67 
 
 		 396 aa  205  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02550  succinylglutamate desuccinylase  38.79 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.99047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1934  succinylglutamate desuccinylase  36.28 
 
 		 342 aa  202  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00118272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1708  succinylglutamate desuccinylase  39.4 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.0550422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2195  succinylglutamate desuccinylase  35.67 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1785  succinylglutamate desuccinylase  38.51 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0703665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2277  succinylglutamate desuccinylase  36.27 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2132  succinylglutamate desuccinylase  35.91 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000127118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2780  succinylglutamate desuccinylase  41.27 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2338  succinylglutamate desuccinylase  36.5 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2029  succinylglutamate desuccinylase  35.91 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299129  hitchhiker  0.000166583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1946  succinylglutamate desuccinylase  35.91 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2236  succinylglutamate desuccinylase  35.95 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00424439  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2148  succinylglutamate desuccinylase  35.95 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000502717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1884  succinylglutamate desuccinylase  35.65 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.823937  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2223  succinylglutamate desuccinylase  35.95 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1121  succinylglutamate desuccinylase  35.01 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4509  succinylglutamate desuccinylase  35.95 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2330  succinylglutamate desuccinylase  35.15 
 
 		 347 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127772 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2198  succinylglutamate desuccinylase  36.15 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3311  succinylglutamate desuccinylase  39.16 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1730  succinylglutamate desuccinylase  33.44 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003688  succinylglutamate desuccinylase  30.58 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02131  succinylglutamate desuccinylase  29.97 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0863  succinylglutamate desuccinylase  32.01 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03011  aspartoacylase  40.48 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1591  aspartoacylase  39.53 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0691  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.04 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2696  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.94 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000509431  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5816  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.02 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6046  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.02 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06634  aspartoacylase  39.73 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04021  aspartoacylase  40 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1785  aspartoacylase  35.37 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0363  aspartoacylase  38.46 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0370  aspartoacylase  38.46 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03237  aspartoacylase  26.85 
 
 		 290 aa  42.7  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>