106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6046 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6046  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 		 349 aa  709    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5816  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  97.71 
 
 		 349 aa  695    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3559  succinylglutamate desuccinylase  34.43 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2905  succinylglutamate desuccinylase  27.96 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4279  succinylglutamate desuccinylase  27.3 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52630  succinylglutamate desuccinylase  39.47 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2685  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.07 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4614  succinylglutamate desuccinylase  40.35 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257138  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3980  succinylglutamate desuccinylase  28.4 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1440  succinylglutamate desuccinylase  27.24 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4475  succinylglutamate desuccinylase  27.24 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3764  succinylglutamate desuccinylase  27.24 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168218  normal  0.0907041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0125  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.44 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2117  succinylglutamate desuccinylase  29.27 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.728086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2516  succinylglutamate desuccinylase  29.27 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1838  succinylglutamate desuccinylase  37.5 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3449  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.77 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2225  succinylglutamate desuccinylase  31.03 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2840  succinylglutamate desuccinylase  29.85 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6573  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.69 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1785  aspartoacylase  22.69 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3068  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.94 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  hitchhiker  0.00852886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4061  hypothetical protein  30.81 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.775806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3406  hypothetical protein  30.81 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0821  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.14 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3605  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.28 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.798177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2119  succinylglutamate desuccinylase  29.74 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0443  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.25 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0431  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.47 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502544  hitchhiker  0.000000995003 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02550  succinylglutamate desuccinylase  25.17 
 
 		 347 aa  53.1  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.99047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1419  succinylglutamate desuccinylase  32.11 
 
 		 322 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1402  succinylglutamate desuccinylase  32.11 
 
 		 322 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2195  succinylglutamate desuccinylase  30.91 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1866  succinylglutamate desuccinylase  32.11 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.934682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2039  succinylglutamate desuccinylase  32.11 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429087  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01713  succinylglutamate desuccinylase  31.93 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1898  succinylglutamate desuccinylase  31.93 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.22228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2780  succinylglutamate desuccinylase  29.13 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1934  succinylglutamate desuccinylase  24.24 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00118272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01701  hypothetical protein  31.93 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1924  succinylglutamate desuccinylase  32.74 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.693854  hitchhiker  0.00111051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1827  succinylglutamate desuccinylase  31.93 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1966  succinylglutamate desuccinylase  31.93 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2247  succinylglutamate desuccinylase  24.81 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195913  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1888  succinylglutamate desuccinylase  31.93 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0217529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1447  succinylglutamate desuccinylase  31.93 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50451 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1990  succinylglutamate desuccinylase  31.93 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.920225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2462  succinylglutamate desuccinylase  31.93 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2330  succinylglutamate desuccinylase  27.23 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127772 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1434  succinylglutamate desuccinylase  32.11 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4296  succinylglutamate desuccinylase  29.38 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1782  succinylglutamate desuccinylase  29.48 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1780  succinylglutamate desuccinylase  27.76 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0767  hypothetical protein  28.5 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0012  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  31.55 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1785  succinylglutamate desuccinylase  27.46 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0703665  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0706  succinylglutamate desuccinylase  28.81 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1185  succinylglutamate desuccinylase  28.81 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0562239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1708  succinylglutamate desuccinylase  26.63 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.0550422 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0596  succinylglutamate desuccinylase  28.09 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0010  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  30.64 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2841  succinylglutamate desuccinylase  28.09 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1517  succinylglutamate desuccinylase  30.64 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1484  hypothetical protein  31.47 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488665  hitchhiker  0.00120854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4700  hypothetical protein  31.54 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1158  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  30.64 
 
 		 408 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2420  succinylglutamate desuccinylase  28.09 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1438  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  30.64 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.480301  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2871  succinylglutamate desuccinylase  28.09 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2722  succinylglutamate desuccinylase  28.09 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0013  succinylglutamate desuccinylase  30.64 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2780  succinylglutamate desuccinylase  28.09 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.578972  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  30.64 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  30.64 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1731  succinylglutamate desuccinylase  28.09 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3311  succinylglutamate desuccinylase  33.33 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2277  succinylglutamate desuccinylase  25 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3357  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.47 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00503474  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3619  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.07 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02521  aspartoacylase  25 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7599  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.48 
 
 		 327 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.596641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1162  succinylglutamate desuccinylase  28.38 
 
 		 342 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.412137  normal  0.073065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1066  succinylglutamate desuccinylase  27.68 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.444137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1819  aspartoacylase  30.77 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4698  aspartoacylase  22.22 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1077  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.26 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2226  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.31 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0488  succinylglutamate desuccinylase  28.02 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3116  Aspartoacylase  23.79 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02441  aspartoacylase  25.33 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1066  succinylglutamate desuccinylase  39.34 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1563  succinylglutamate desuccinylase  29.53 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0370  aspartoacylase  25 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0363  aspartoacylase  25 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0224  aspartoacylase  23.61 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2918  succinylglutamate desuccinylase  28.89 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.354505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2029  succinylglutamate desuccinylase  25 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299129  hitchhiker  0.000166583 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02421  aspartoacylase  24.31 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0517  aspartoacylase  26.77 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0707886  normal  0.268536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2338  succinylglutamate desuccinylase  24.58 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>