47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04021 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_04021  aspartoacylase  100 
 
 
323 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02441  aspartoacylase  54.66 
 
 
335 aa  355  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1819  aspartoacylase  58.75 
 
 
303 aa  355  7.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1591  aspartoacylase  51.66 
 
 
305 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03011  aspartoacylase  51.66 
 
 
305 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0517  aspartoacylase  57.48 
 
 
304 aa  325  8.000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0707886  normal  0.268536 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02521  aspartoacylase  44.71 
 
 
298 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0224  aspartoacylase  43.71 
 
 
301 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02431  aspartoacylase  45.48 
 
 
301 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.378345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02421  aspartoacylase  44.59 
 
 
301 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4698  aspartoacylase  35.79 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1785  aspartoacylase  35.92 
 
 
293 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3116  Aspartoacylase  36.49 
 
 
292 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0370  aspartoacylase  32.39 
 
 
289 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0363  aspartoacylase  32.39 
 
 
289 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1144  aspartoacylase  29.76 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.451736  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03237  aspartoacylase  31.01 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06634  aspartoacylase  30.66 
 
 
295 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44003  predicted protein  27.24 
 
 
354 aa  85.9  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0157788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3769  Aspartoacylase  34.55 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.456471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0691  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.13 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2840  succinylglutamate desuccinylase  36.94 
 
 
327 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2905  succinylglutamate desuccinylase  32.54 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1884  succinylglutamate desuccinylase  28.49 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.823937  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2338  succinylglutamate desuccinylase  25.53 
 
 
344 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1946  succinylglutamate desuccinylase  31.54 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2029  succinylglutamate desuccinylase  32.03 
 
 
344 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299129  hitchhiker  0.000166583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2132  succinylglutamate desuccinylase  31.54 
 
 
344 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000127118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1440  succinylglutamate desuccinylase  31.25 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2198  succinylglutamate desuccinylase  27.57 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4475  succinylglutamate desuccinylase  30.63 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.135424 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0488  succinylglutamate desuccinylase  40 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2148  succinylglutamate desuccinylase  27.57 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000502717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2223  succinylglutamate desuccinylase  27.57 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2236  succinylglutamate desuccinylase  27.57 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00424439  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4509  succinylglutamate desuccinylase  27.57 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3764  succinylglutamate desuccinylase  30.63 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168218  normal  0.0907041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3980  succinylglutamate desuccinylase  30.63 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38197  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2780  succinylglutamate desuccinylase  38.1 
 
 
326 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1708  succinylglutamate desuccinylase  28.78 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.0550422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2119  succinylglutamate desuccinylase  33.33 
 
 
349 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3559  succinylglutamate desuccinylase  33.1 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6046  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.09 
 
 
349 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5816  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.09 
 
 
349 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1419  succinylglutamate desuccinylase  34.43 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2008  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.26 
 
 
294 aa  42.7  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.49832 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1402  succinylglutamate desuccinylase  34.43 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.200021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>