32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0517 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0517  aspartoacylase  100 
 
 
304 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0707886  normal  0.268536 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1819  aspartoacylase  64.03 
 
 
303 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04021  aspartoacylase  57.28 
 
 
323 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02441  aspartoacylase  50.49 
 
 
335 aa  315  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1591  aspartoacylase  47.39 
 
 
305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03011  aspartoacylase  46.73 
 
 
305 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02521  aspartoacylase  42.66 
 
 
298 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0224  aspartoacylase  42.11 
 
 
301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02421  aspartoacylase  41.45 
 
 
301 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02431  aspartoacylase  41.89 
 
 
301 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.378345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4698  aspartoacylase  33.92 
 
 
293 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1785  aspartoacylase  33.68 
 
 
293 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3116  Aspartoacylase  33.9 
 
 
292 aa  159  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0363  aspartoacylase  29.68 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0370  aspartoacylase  29.68 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1144  aspartoacylase  27.24 
 
 
297 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.451736  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03237  aspartoacylase  30.8 
 
 
290 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06634  aspartoacylase  28.86 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44003  predicted protein  28.05 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0157788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3769  Aspartoacylase  35.19 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.456471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3559  succinylglutamate desuccinylase  32.61 
 
 
335 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4614  succinylglutamate desuccinylase  41.11 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52630  succinylglutamate desuccinylase  36.8 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1782  succinylglutamate desuccinylase  35.14 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327695  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4279  succinylglutamate desuccinylase  34.56 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3980  succinylglutamate desuccinylase  32 
 
 
335 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38197  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6046  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.77 
 
 
349 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5816  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.27 
 
 
349 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3764  succinylglutamate desuccinylase  30.71 
 
 
335 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168218  normal  0.0907041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2905  succinylglutamate desuccinylase  38.37 
 
 
337 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1838  succinylglutamate desuccinylase  31.71 
 
 
335 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1440  succinylglutamate desuccinylase  32 
 
 
335 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>