59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1591 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1591  aspartoacylase  100 
 
 
305 aa  630  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03011  aspartoacylase  99.34 
 
 
305 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02441  aspartoacylase  55.08 
 
 
335 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04021  aspartoacylase  51.66 
 
 
323 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1819  aspartoacylase  47.19 
 
 
303 aa  311  7.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0517  aspartoacylase  47.96 
 
 
304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0707886  normal  0.268536 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02431  aspartoacylase  49.16 
 
 
301 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.378345  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0224  aspartoacylase  47.37 
 
 
301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02421  aspartoacylase  47.04 
 
 
301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02521  aspartoacylase  46.78 
 
 
298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1785  aspartoacylase  33.45 
 
 
293 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4698  aspartoacylase  33.22 
 
 
293 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3116  Aspartoacylase  31.47 
 
 
292 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0370  aspartoacylase  31.1 
 
 
289 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0363  aspartoacylase  31.1 
 
 
289 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1144  aspartoacylase  27.3 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.451736  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03237  aspartoacylase  26.3 
 
 
290 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06634  aspartoacylase  25.95 
 
 
295 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3769  Aspartoacylase  34.26 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.456471 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44003  predicted protein  22.41 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0157788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2840  succinylglutamate desuccinylase  35.78 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0488  succinylglutamate desuccinylase  39.53 
 
 
340 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0691  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.28 
 
 
302 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2039  succinylglutamate desuccinylase  33.64 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429087  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3559  succinylglutamate desuccinylase  33.09 
 
 
335 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1402  succinylglutamate desuccinylase  32.71 
 
 
322 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1419  succinylglutamate desuccinylase  32.41 
 
 
322 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1434  succinylglutamate desuccinylase  33.64 
 
 
322 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1866  succinylglutamate desuccinylase  32.71 
 
 
322 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.934682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2338  succinylglutamate desuccinylase  26.41 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1884  succinylglutamate desuccinylase  25.21 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.823937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1838  succinylglutamate desuccinylase  35.9 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2198  succinylglutamate desuccinylase  25.64 
 
 
344 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2148  succinylglutamate desuccinylase  25.64 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000502717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2236  succinylglutamate desuccinylase  25.64 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00424439  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2223  succinylglutamate desuccinylase  25.64 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4509  succinylglutamate desuccinylase  25.64 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2905  succinylglutamate desuccinylase  32.48 
 
 
337 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1946  succinylglutamate desuccinylase  26.37 
 
 
344 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2132  succinylglutamate desuccinylase  26.37 
 
 
344 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000127118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4279  succinylglutamate desuccinylase  33.33 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2029  succinylglutamate desuccinylase  26.37 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299129  hitchhiker  0.000166583 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1898  succinylglutamate desuccinylase  30.09 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.22228  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2462  succinylglutamate desuccinylase  30.09 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01701  hypothetical protein  30.09 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1990  succinylglutamate desuccinylase  30.09 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.920225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1447  succinylglutamate desuccinylase  30.09 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1888  succinylglutamate desuccinylase  30.09 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0217529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1827  succinylglutamate desuccinylase  30.09 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01713  succinylglutamate desuccinylase  30.09 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3764  succinylglutamate desuccinylase  26.88 
 
 
335 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168218  normal  0.0907041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2225  succinylglutamate desuccinylase  30.19 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1966  succinylglutamate desuccinylase  30.09 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1700  succinylglutamate desuccinylase  33.33 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4475  succinylglutamate desuccinylase  26.52 
 
 
335 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.135424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1440  succinylglutamate desuccinylase  26.53 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.67 
 
 
350 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3980  succinylglutamate desuccinylase  26.88 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38197  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52630  succinylglutamate desuccinylase  36.51 
 
 
332 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>