86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0691 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0691  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 		 302 aa  630  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1898  succinylglutamate desuccinylase  37.74 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.22228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01701  hypothetical protein  37.74 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2462  succinylglutamate desuccinylase  37.74 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1990  succinylglutamate desuccinylase  37.74 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.920225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01713  succinylglutamate desuccinylase  37.74 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1447  succinylglutamate desuccinylase  37.74 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1888  succinylglutamate desuccinylase  37.74 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0217529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1827  succinylglutamate desuccinylase  37.74 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0431  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.45 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502544  hitchhiker  0.000000995003 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1966  succinylglutamate desuccinylase  37.74 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0443  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.79 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0125  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3068  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.52 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  hitchhiker  0.00852886 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6573  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.34 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3605  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.23 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.798177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0767  hypothetical protein  23.71 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1934  succinylglutamate desuccinylase  28.7 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00118272  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3449  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.57 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1484  hypothetical protein  23.83 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488665  hitchhiker  0.00120854 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2117  succinylglutamate desuccinylase  31.13 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.728086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2516  succinylglutamate desuccinylase  31.13 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04021  aspartoacylase  29.13 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1924  succinylglutamate desuccinylase  26.67 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.693854  hitchhiker  0.00111051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3559  succinylglutamate desuccinylase  34.67 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52630  succinylglutamate desuccinylase  32.26 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0488  succinylglutamate desuccinylase  28.04 
 
 		 340 aa  50.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1700  succinylglutamate desuccinylase  39.34 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2247  succinylglutamate desuccinylase  29.25 
 
 		 345 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2277  succinylglutamate desuccinylase  26.42 
 
 		 345 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03011  aspartoacylase  30.28 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1591  aspartoacylase  30.28 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4614  succinylglutamate desuccinylase  31.18 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257138  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1730  succinylglutamate desuccinylase  34.78 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2039  succinylglutamate desuccinylase  28.57 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1402  succinylglutamate desuccinylase  28.57 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1419  succinylglutamate desuccinylase  28.57 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4279  succinylglutamate desuccinylase  33.33 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2225  succinylglutamate desuccinylase  30.19 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  23.63 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0010  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  23.63 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1434  succinylglutamate desuccinylase  28.57 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1866  succinylglutamate desuccinylase  28.57 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.934682  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1438  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  23.63 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.480301  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1158  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  23.63 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1838  succinylglutamate desuccinylase  35.71 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2905  succinylglutamate desuccinylase  27.43 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2379  putative succinylglutamate desuccinylase  31.9 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0683  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.86 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2302  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.63 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1440  succinylglutamate desuccinylase  31.33 
 
 		 335 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3764  succinylglutamate desuccinylase  31.33 
 
 		 335 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168218  normal  0.0907041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4475  succinylglutamate desuccinylase  31.33 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2330  succinylglutamate desuccinylase  26.42 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1782  succinylglutamate desuccinylase  29.91 
 
 		 347 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.327695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0013  succinylglutamate desuccinylase  23.29 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0013  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  23.29 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3357  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.73 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00503474  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3980  succinylglutamate desuccinylase  31.33 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1517  succinylglutamate desuccinylase  22.95 
 
 		 407 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1785  succinylglutamate desuccinylase  25.47 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0703665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1731  succinylglutamate desuccinylase  39.34 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2918  succinylglutamate desuccinylase  30.16 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.354505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0863  succinylglutamate desuccinylase  33.8 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1780  succinylglutamate desuccinylase  34.25 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2871  succinylglutamate desuccinylase  39.34 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06634  aspartoacylase  31.25 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0596  succinylglutamate desuccinylase  39.34 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3311  succinylglutamate desuccinylase  35.29 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.433122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.68 
 
 		 359 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2722  succinylglutamate desuccinylase  39.34 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2420  succinylglutamate desuccinylase  39.34 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1185  succinylglutamate desuccinylase  34.92 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0562239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2780  succinylglutamate desuccinylase  39.34 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.578972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2841  succinylglutamate desuccinylase  39.34 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2119  succinylglutamate desuccinylase  24.79 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2840  succinylglutamate desuccinylase  27.62 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0706  succinylglutamate desuccinylase  34.92 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5816  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.34 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02131  succinylglutamate desuccinylase  27.5 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1819  aspartoacylase  29.46 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2696  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.39 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000509431  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0012  succinylglutamate desuccinylase / aspartoacylase family protein  23.63 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1708  succinylglutamate desuccinylase  26.26 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.0550422 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7599  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.41 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.596641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1066  succinylglutamate desuccinylase  33.78 
 
 		 367 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>