58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06634 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06634  aspartoacylase  100 
 
 
295 aa  619  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1144  aspartoacylase  40.61 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.451736  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03237  aspartoacylase  40.89 
 
 
290 aa  219  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1785  aspartoacylase  34.44 
 
 
293 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4698  aspartoacylase  32.55 
 
 
293 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3116  Aspartoacylase  33.22 
 
 
292 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0370  aspartoacylase  33.22 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0363  aspartoacylase  33.22 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04021  aspartoacylase  30.66 
 
 
323 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02421  aspartoacylase  26.03 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0224  aspartoacylase  26.21 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44003  predicted protein  26.99 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0157788  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02431  aspartoacylase  26.71 
 
 
301 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.378345  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03011  aspartoacylase  25.95 
 
 
305 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1591  aspartoacylase  25.95 
 
 
305 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0517  aspartoacylase  28.86 
 
 
304 aa  99  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0707886  normal  0.268536 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02441  aspartoacylase  26.44 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02521  aspartoacylase  24.92 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1819  aspartoacylase  26.99 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3769  Aspartoacylase  41.59 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.456471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4614  succinylglutamate desuccinylase  27.83 
 
 
332 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.257138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2039  succinylglutamate desuccinylase  33.33 
 
 
322 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429087  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52630  succinylglutamate desuccinylase  27.19 
 
 
332 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1700  succinylglutamate desuccinylase  32.41 
 
 
321 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2840  succinylglutamate desuccinylase  33.94 
 
 
327 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1866  succinylglutamate desuccinylase  29.13 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.934682  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1402  succinylglutamate desuccinylase  29.13 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1419  succinylglutamate desuccinylase  29.13 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1176  deacylase-like protein  30.65 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1785  succinylglutamate desuccinylase  30.91 
 
 
348 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0703665  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1434  succinylglutamate desuccinylase  29.13 
 
 
322 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2117  succinylglutamate desuccinylase  31.43 
 
 
330 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.728086  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1934  succinylglutamate desuccinylase  31.53 
 
 
342 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00118272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2516  succinylglutamate desuccinylase  31.43 
 
 
330 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2905  succinylglutamate desuccinylase  40 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2225  succinylglutamate desuccinylase  31.43 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4279  succinylglutamate desuccinylase  33.33 
 
 
336 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0488  succinylglutamate desuccinylase  39.73 
 
 
340 aa  45.8  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0691  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.25 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0596  succinylglutamate desuccinylase  35.29 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2841  succinylglutamate desuccinylase  35.29 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2722  succinylglutamate desuccinylase  35.29 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2871  succinylglutamate desuccinylase  35.29 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1731  succinylglutamate desuccinylase  35.29 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2780  succinylglutamate desuccinylase  35.29 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.578972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2247  succinylglutamate desuccinylase  29.2 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2420  succinylglutamate desuccinylase  35.29 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1708  succinylglutamate desuccinylase  34.44 
 
 
348 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.0550422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1780  succinylglutamate desuccinylase  36.92 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.894173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3559  succinylglutamate desuccinylase  30.97 
 
 
335 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2338  succinylglutamate desuccinylase  26.61 
 
 
344 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01701  hypothetical protein  27.18 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1898  succinylglutamate desuccinylase  27.18 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.22228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1990  succinylglutamate desuccinylase  27.18 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.920225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1447  succinylglutamate desuccinylase  27.18 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1888  succinylglutamate desuccinylase  27.18 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0217529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1827  succinylglutamate desuccinylase  27.18 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01713  succinylglutamate desuccinylase  27.18 
 
 
322 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>