55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22830 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22830  predicted deacylase  100 
 
 
345 aa  713    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3353  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.84 
 
 
311 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0643  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.92 
 
 
314 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0486268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.81 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0644  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.8 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.33 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.66 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.66 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  25 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22840  predicted deacylase  21.28 
 
 
320 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.12 
 
 
350 aa  56.6  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.09 
 
 
343 aa  56.2  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  26.67 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004275  predicted deacylase  24.26 
 
 
355 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0385  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  25.71 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1792  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  25.71 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  22.76 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.63 
 
 
345 aa  53.9  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1548  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.63 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.34 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.37 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1563  succinylglutamate desuccinylase/Aspartoacylase family protein  21.68 
 
 
345 aa  53.1  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.71 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1213  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.51 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.27 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0100  deacylase-like  24.59 
 
 
510 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2352  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.15 
 
 
355 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0010542  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2858  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.78 
 
 
337 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.211613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0204  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.13 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2432  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.88 
 
 
396 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362686  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.21 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.11 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2953  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.11 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.124996  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1385  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.11 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3803  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.98 
 
 
481 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3576  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.92 
 
 
311 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107365  normal  0.907125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2690  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.78 
 
 
337 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2758  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.78 
 
 
337 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2778  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.86 
 
 
346 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  22.22 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2639  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.1 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.19 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1417  hypothetical protein  33.33 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1583  hypothetical protein  22.54 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1424  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.76 
 
 
337 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1092  hypothetical protein  21.63 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1440  succinylglutamate desuccinylase  33.05 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104611  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3764  succinylglutamate desuccinylase  33.05 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168218  normal  0.0907041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7662  putative succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.52 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0687  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.46 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3134  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.45 
 
 
314 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4475  succinylglutamate desuccinylase  32.2 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.135424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3980  succinylglutamate desuccinylase  32.2 
 
 
335 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38197  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1312  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.76 
 
 
337 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0279  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.95 
 
 
345 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>