More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1350 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1350  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  100 
 
 
252 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.175696  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0935  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.43 
 
 
251 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
235 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0987  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.06 
 
 
251 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3369  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.06 
 
 
251 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.589225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.3 
 
 
256 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.936397  normal  0.224474 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2747  gluconate 5-dehydrogenase  28.2 
 
 
253 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
264 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.5 
 
 
240 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76943  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.89 
 
 
255 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.966986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3149  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.7 
 
 
240 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
257 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.54 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 
253 aa  99  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00235361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.21 
 
 
240 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0723888  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  28.63 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0620  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.65 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  28.96 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10890  putative short-chain dehydrogenase  27.71 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0306888  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03889  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14350)  30.08 
 
 
394 aa  96.3  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.696227  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.19 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.3 
 
 
240 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  28.57 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  28.41 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.3 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1716  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  25.78 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.59 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
263 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34739  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2643  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.62 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.802213  normal  0.105966 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  29.15 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1693  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.62 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.523034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0468  gluconate 5-dehydrogenase  29.53 
 
 
251 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1803  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.62 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  28.41 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  29.15 
 
 
258 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  27.59 
 
 
255 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.14 
 
 
248 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  28.03 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.38 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.34 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3895  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.07 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.9 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.819971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.9 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5308  dehydrogenase  30.47 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.79 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.38 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17930  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  29.62 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.481868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  25.79 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.79 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117337  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2406  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27.24 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27 
 
 
261 aa  92  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1909  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27.31 
 
 
253 aa  92  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00371976  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04132  gluconate 5-dehydrogenase  26.52 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.52 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3233  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  26.94 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0999  putative short-chain dehydrogenase  27.71 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2263  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.46 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0669  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  28.57 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0399726  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.69 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
236 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.433499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.3 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0335723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04096  hypothetical protein  26.52 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3349  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143786 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.05 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4522  gluconate 5-dehydrogenase  26.52 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4747  gluconate 5-dehydrogenase  26.52 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3185  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27.38 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358502  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1971  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  25.69 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4264  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27.97 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4868  gluconate 5-dehydrogenase  27.44 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.113188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.89 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3248  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  26.62 
 
 
253 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371746 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0349  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.24 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3168  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  26.62 
 
 
253 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  25 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2646  phosphatidylserine decarboxylase  27.34 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229989  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  28.24 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2032  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  25.95 
 
 
253 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.46 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0628218  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>