137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82718 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_82718  predicted protein  100 
 
 
1408 aa  2854    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.291981 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_8000  predicted protein  38.33 
 
 
119 aa  90.5  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13158  SpoU rRNA methylase family protein  34.03 
 
 
171 aa  70.1  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  31.11 
 
 
164 aa  61.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0817  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.49 
 
 
219 aa  59.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0802  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.73 
 
 
229 aa  57.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.681579  hitchhiker  0.00885649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0856  putative methyltransferase  27.22 
 
 
397 aa  57.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.972031  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04831  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.59 
 
 
224 aa  57  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.61 
 
 
176 aa  56.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482713  normal  0.100378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3334  putative methyltransferase  26.95 
 
 
382 aa  56.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2517  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.9 
 
 
266 aa  56.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.59 
 
 
223 aa  56.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0125765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3490  putative methyltransferase  27.54 
 
 
383 aa  55.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4315  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.52 
 
 
174 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169857  hitchhiker  0.00596209 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0418  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.9 
 
 
223 aa  54.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4179  tRNA/rRNA methyltransferase, SpoU  25.16 
 
 
225 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0240712  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2234  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  26.49 
 
 
216 aa  54.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3203  putative methyltransferase  25.15 
 
 
395 aa  55.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3462  putative methyltransferase  25.15 
 
 
388 aa  55.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.819699  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4608  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.9 
 
 
172 aa  54.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.443527 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3340  putative methyltransferase  25.15 
 
 
388 aa  55.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4332  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.16 
 
 
225 aa  55.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2860  putative methyltransferase  25.32 
 
 
345 aa  54.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.720716  normal  0.337027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2864  putative methyltransferase  25.32 
 
 
345 aa  55.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  0.615329 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2842  putative methyltransferase  25.32 
 
 
345 aa  55.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2758  putative methyltransferase  25.32 
 
 
345 aa  55.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00146389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2976  putative methyltransferase  25.32 
 
 
345 aa  55.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1577  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  26.71 
 
 
229 aa  53.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1199  tRNA/rRNA methyltransferase  30.26 
 
 
234 aa  54.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354486  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3469  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein  31.58 
 
 
161 aa  54.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.029361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4148  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.44 
 
 
230 aa  53.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04421  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.59 
 
 
223 aa  54.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.961343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  28.37 
 
 
152 aa  54.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00157  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.52 
 
 
235 aa  53.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0888  putative methyltransferase  26.21 
 
 
349 aa  53.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00286153  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4310  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.16 
 
 
225 aa  53.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  25.66 
 
 
258 aa  53.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3960  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.49 
 
 
229 aa  52.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4130  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.49 
 
 
229 aa  52.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3496  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  26.28 
 
 
234 aa  52.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000329165 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0088  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.36 
 
 
229 aa  52.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3066  putative methyltransferase  23.68 
 
 
365 aa  52.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  26.9 
 
 
164 aa  52.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1255  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  25.66 
 
 
219 aa  52.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.87838  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3561  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.69 
 
 
168 aa  52.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3986  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.49 
 
 
229 aa  52.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.4 
 
 
239 aa  52.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03508  tRNA (Guanosine-2'-O-)-methyltransferase  25.49 
 
 
229 aa  52  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0054  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.49 
 
 
229 aa  52  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  28 
 
 
250 aa  52.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03460  hypothetical protein  25.49 
 
 
229 aa  52  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0038  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.68 
 
 
230 aa  52  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3862  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.49 
 
 
229 aa  52  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4154  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.49 
 
 
229 aa  52  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0042  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.68 
 
 
230 aa  52  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0060  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.49 
 
 
229 aa  52  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2520  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.37 
 
 
173 aa  52.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4102  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.49 
 
 
229 aa  52  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.49 
 
 
229 aa  52  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4179  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.68 
 
 
219 aa  52  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2737  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.6 
 
 
244 aa  51.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20701  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.03 
 
 
229 aa  51.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3745  putative methyltransferase  24.85 
 
 
366 aa  51.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.319573  normal  0.284023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2288  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25 
 
 
180 aa  50.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000472239  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2141  RNA methyltransferase  25.16 
 
 
257 aa  50.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  23.93 
 
 
250 aa  50.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0929  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  26.67 
 
 
216 aa  50.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.84 
 
 
229 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4069  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.84 
 
 
229 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.84 
 
 
229 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339816  normal  0.0254174 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0099  RNA methyltransferase, TrmH family  33.33 
 
 
268 aa  50.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.167605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.41 
 
 
158 aa  50.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001865  tRNA (Guanosine18-2'-O-)-methyltransferase  24.85 
 
 
227 aa  50.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.84 
 
 
230 aa  50.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.545722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0351  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25 
 
 
250 aa  49.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  25.16 
 
 
257 aa  49.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4212  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  23.53 
 
 
230 aa  49.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0197  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.24 
 
 
210 aa  49.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.66 
 
 
416 aa  49.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4495  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  23.53 
 
 
230 aa  49.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4068  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.17 
 
 
225 aa  49.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  27.4 
 
 
162 aa  49.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.17 
 
 
229 aa  48.9  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.14 
 
 
250 aa  48.9  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.66 
 
 
442 aa  48.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00626  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.85 
 
 
227 aa  48.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4870  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.18 
 
 
231 aa  48.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04781  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.19 
 
 
229 aa  48.5  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.4365  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0830  RNA methyltransferase  30.2 
 
 
226 aa  48.5  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0190975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1528  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  24.81 
 
 
220 aa  48.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.16942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1901  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.78 
 
 
175 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0053  tRNA/rRNA methyltransferase  26.28 
 
 
218 aa  48.5  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1756  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.19 
 
 
229 aa  48.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11883  spoU protein (spoU)  25.19 
 
 
238 aa  47.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1972  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.19 
 
 
197 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0293079 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1148  RNA methyltransferase  29.05 
 
 
226 aa  47.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0766  hypothetical protein  26.97 
 
 
177 aa  48.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02439  hypothetical protein  23.59 
 
 
345 aa  47  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2868  putative methyltransferase  23.59 
 
 
345 aa  47  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00725201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3818  putative methyltransferase  23.59 
 
 
345 aa  47  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00192845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>